细胞应激下SERPINA1 3'UTR多聚腺苷酸化位点使用改变影响A1AT蛋白表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE277810

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数据说明

选择性多聚腺苷酸化导致信使RNA（mRNA）转录本产生不同的3’亚型。3’非翻译区（3’UTR）的选择性多聚腺苷酸化可改变RNA的定位、稳定性和翻译效率。SERPINA1 mRNA具有两种不同的3’UTR亚型，二者均表达蛋白酶抑制剂α-1-抗胰蛋白酶（A1AT）。A1AT是一种急性期蛋白，由肝细胞表达并分泌，在炎症期间上调。肺部A1AT水平过低可导致慢性阻塞性肺疾病，而肝脏中A1AT的错误折叠则可导致肝硬化。我们通过用细胞因子白细胞介素6（IL-6）、乙醇或过氧化物处理肝细胞系HepG2，分析了细胞应激过程中选择性多聚腺苷酸化的动态变化。IL-6处理后SERPINA1的转录上调，且多聚腺苷酸化发生改变，导致长3’UTR亚型增加。我们发现，即使SERPINA1 mRNA水平很高，长3’UTR仍抑制内源性A1AT蛋白的表达。SERPINA1的表达及3’端加工不受乙醇或过氧化物的影响。

IL-6诱导的转录组范围转录调控变化提示内质网及分泌蛋白加工过程发生改变。我们的数据表明，炎症影响SERPINA1转录本的polyA位点选择，导致A1AT蛋白表达减少。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。