上皮细胞膜穿孔诱导过敏性气道炎症
该数据集来自 NCBI GEO,标题为上皮细胞膜穿孔诱导过敏性气道炎症,包含 1 个文件 GSE276386_series_matrix.txt.gz,属于呼吸系统疾病分类下的表达谱数据

基本信息
资源简介
上皮细胞膜穿孔诱导过敏性气道炎症
Epithelial Cell Membrane Perforation Induces Allergic Airway Inflammation
该数据集来自 NCBI GEO,标题为上皮细胞膜穿孔诱导过敏性气道炎症,包含 1 个文件 GSE276386_series_matrix.txt.gz,属于呼吸系统疾病分类下的表达谱数据。数据基于高通量测序平台 GPL24247 和物种 9606,可用于研究过敏原激活 2 型免疫应答的机制,特别是气道上皮细胞对成孔蛋白的感知与免疫激活过程(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 04 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):诱导过敏性气道炎症的过敏原高度多样,但它们通常激活 2 型免疫应答1,2。气道上皮细胞在过敏原的免疫感知中至关重要3-5。然而,多样过敏原之间哪些共同特征导致其相似的先天免疫感知,以及上皮细胞如何检测这些特征,仍不清楚1,2,6-9。在此,我们展示成孔蛋白是过敏性气道炎症的常见刺激物之一,并阐明其免疫激活机制。以常见的霉菌过敏原链格孢(A. alternata)为模型,我们建立了一个独特的体外系统来研究 2 型先天免疫感知。通过六步生化分离,我们鉴定其核心免疫刺激成分为 Aeg-S 和 Aeg-L。生化重构和冷冻电子显微镜表明,这
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、9606。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE276386
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 18 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
诱导过敏性气道炎症的变应原高度多样,但它们通常会激活2型免疫应答1,2。气道上皮细胞在变应原的免疫感知中至关重要3-5。然而,多样变应原之间哪些共同特征导致其相似的固有免疫感知,以及上皮细胞如何检测这些特征,仍不清楚1,2,6-9。在此,我们证明成孔蛋白是过敏性气道炎症的常见刺激因素之一,并阐明了其免疫激活机制。以常见的霉菌变应原链格孢(Alternaria alternata,A. alternata)为模型,我们建立了一个独特的体外系统来研究2型固有免疫感知。通过六步生化分离,我们鉴定出其核心免疫刺激组分为Aeg-S和Aeg-L。生化重构和冷冻电镜表明,这些蛋白形成16–20聚体跨膜孔复合物。它们的协同穿孔作用作为真正的2型免疫佐剂,支持抗原特异性TH2和IgE应答。基因工程A.
缺乏此类成孔活性的链格孢菌菌株无法在小鼠中诱导过敏性反应。此外,来自不同物种的成孔蛋白尽管在结构和膜靶点上存在差异,却足以触发呼吸道过敏。气道上皮细胞的穿孔通过两种机制启动过敏性反应:其一触发IL-33释放;其二涉及Ca2+内流,进而诱导MAPK通路激活和2型炎症基因表达。这些发现揭示了2型免疫反应如何检测由结构多样的刺激物引起的共同扰动。靶向上皮细胞穿孔的下游信号传导可能为治疗呼吸道过敏开辟新途径。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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