Igf1r缺陷对对照及博来霉素诱导小鼠肺转录组影响研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE274184

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

急性肺损伤（ALI）、ARDS和COVID-19通常涉及“细胞因子风暴”。IGF1R（胰岛素样生长因子受体1）维持肺稳态，并参与这些肺部炎症性疾病。在小鼠中，据报道广泛的IGF1R缺陷可抵消博来霉素（BLM）诱导的ALI后的呼吸道炎症和肺泡损伤。为探究BLM刺激后由Igf1r信号介导的分子机制，我们对BLM或生理盐水（SAL）滴注后IGF1R缺陷小鼠的肺进行了RNA测序。转录组分析鉴定了BLM刺激与SAL处理的对照肺之间的差异表达基因，检测到参与ALI病理生物学的生物学过程和信号通路。BLM刺激小鼠中的Igf1r缺失逆转了BLM引发的大部分转录变化，抵消了炎症性“细胞因子风暴”的转录组谱。数据挖掘还鉴定出在DNA损伤、代谢重编程、线粒体稳态和表观遗传学中具有关键作用的基因簇表达变化。

对这些功能群的探索，结合验证性研究，为Igf1r缺陷减轻ALI作用的分子机制提供了新见解。这些发现使得在转录水平上对IGF1R信号传导有了更全面的认识，强化了其在促进ALI中的重要作用，并推测其作为ARDS中全局性表观遗传调控因子的角色。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。