GSE272904：Hermansky-Pudlak综合征相关肺纤维化中衰老相关炎症成纤维细胞的出现

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272904

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

驱动肺纤维化的纵向细胞相互作用尚不明确。为探究与纤维化发生和进展相关的疾病基础，我们构建了年轻和老年小鼠模型的肺单细胞RNA测序（scRNAseq）图谱，这些模型涵盖Hermansky-Pudlak综合征（HPS）的多个亚型。HPS是一组罕见的常染色体隐性遗传病，与白化病、血小板功能障碍和肺纤维化相关。我们在HPS小鼠中发现了SAA3+炎症性肺成纤维细胞的年龄依赖性增加，包括在自发形成纤维化的HPS1-2双突变小鼠中。HPS1成纤维细胞显示IL-1R1表达增加，而HPS2小鼠的肺泡II型上皮细胞在共培养的成纤维细胞中诱导了炎症基因特征。对三名HPS1患者肺组织的scRNAseq同样显示存在炎症性成纤维细胞以及成纤维细胞上IL1R1表达增加。这些数据提示功能失调的上皮细胞、炎症性成纤维细胞和招募的免疫细胞之间存在复杂的相互作用，为缓解纤维化级联反应提供了潜在机会。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。