NCBI GEO 的 GSE27128 原始数据层

机械通气所致肺损伤可导致 ARDS 等严重病症,这些病症与高死亡率相关(约 30%,Stapleton et al., Chest, 2005)

synapse
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基因组分类呼吸系统疾病机械通气肺损伤ARDS基因表达GEO原始数据
GSE27128 Raw Data Layer from NCBI GEO

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

NCBI GEO 的 GSE27128 原始数据层

GSE27128 Raw Data Layer from NCBI GEO 是一个与呼吸系统疾病相关的数据集,归类于呼吸系统疾病 / 其他方向。该数据集来源于 synapse.org,其核心关注点是机械通气所致肺损伤及其可能引发的严重临床后果。根据源站描述,机械通气所致肺损伤可进一步导致急性呼吸窘迫综合征(ARDS)等严重病症,而这些病症与较高的死亡率相关,约为 30%(Stapleton et al., Chest, 2005)。基于这一临床背景,相关研究提出假设,认为不同基因表达水平的变化可能有助于揭示机械通气所致肺损伤的发生机制或相关生物学过程。该数据集作为 NCBI GEO 的原始数据层,为探索上述假设提供了数据基础。

【数据集背景】

该数据集所涉及的医学背景集中于机械通气所致肺损伤。机械通气是重症监护中常用的生命支持手段,但不当或过度的机械通气本身可能造成肺组织损伤,并进一步发展为急性呼吸窘迫综合征等严重病症。源站描述指出,这类病症与高死亡率相关,死亡率约为 30%(Stapleton et al., Chest, 2005)。在此背景下,研究者提出假设,认为不同基因表达水平的变化可能引导他们发现与机械通气所致肺损伤相关的关键分子事件。该数据集正是围绕这一研究假设而组织,属于呼吸系统疾病 / 其他分类下的数据资源。

【数据内容】

该数据集为 GSE27128 Raw Data Layer from NCBI GEO,即来自 NCBI GEO 的原始数据层。其具体数据内容、样本数量、基因数量、平台信息、文件格式与数据规模等,源站未提供。该数据集被归类为呼吸系统疾病 / 其他,表明其与呼吸系统疾病研究相关,但更细粒度的数据构成信息在现有来源中未予说明。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 synapse.org。其英文名称为 GSE27128 Raw Data Layer from NCBI GEO,表明其与 NCBI GEO 数据库中的 GSE27128 相关,并以原始数据层的形式呈现。关于样本采集方式、实验设计、动物模型或人体样本来源、时间跨度、采集地点与具体实验条件等,源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集适用于围绕机械通气所致肺损伤及其与 ARDS 等严重病症关联的研究。具体而言,可用于探索不同基因表达水平变化是否与机械通气所致肺损伤相关,或用于验证“基因表达变化可能引导研究者理解该损伤机制”这一假设。该数据集属于呼吸系统疾病 / 其他分类,因此也可能适用于呼吸系统疾病领域中与机械通气、肺损伤或 ARDS 相关的二次分析。但关于其是否适用于临床诊断、预后预测、药物靶点发现等具体场景,源站未提供明确说明。

【使用方法】

该数据集为 NCBI GEO 的原始数据层,通常需要结合相应的数据处理流程进行分析。然而,关于具体的下载方式、数据预处理步骤、标准化方法、分析工具与流程、质量控制标准等,源站未提供。因此,无法依据现有信息给出明确的使用操作指南。

【质量与限制】

该数据集来源于 synapse.org,并关联 NCBI GEO 的 GSE27128 原始数据层。关于数据质量、缺失值情况、批次效应、样本代表性、技术偏差与验证程度等,源站未提供。其限制方面,源站描述仅提及机械通气所致肺损伤可导致 ARDS 等严重病症且与高死亡率相关,并提出基因表达变化可能引导研究假设,但未说明该数据集本身在统计效力、重复性、适用范围与结论外推方面的具体限制。

【引用与许可】

该数据集关联的源站描述中引用了 Stapleton et al., Chest, 2005,用于支持机械通气所致肺损伤相关病症死亡率约为 30% 的陈述。关于该数据集本身的正式引用格式、许可协议、使用条款、署名要求与商业使用限制等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://synapse.org/Synapse:syn256916

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

呼吸机相关性肺损伤可导致如ARDS等严重状况,其与高死亡率相关(约30%,Stapleton等,《胸科》,2005年)。我们假设不同基因表达水平的变化会引导我们找到

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