成纤维细胞来源的骨甘氨酸促进肺泡上皮细胞修复

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271272

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数据说明

针对慢性疾病（如慢性阻塞性肺疾病）中上皮修复缺陷的药理学治疗需求日益增加。间充质微环境在修复过程中引导上皮祖细胞活化方面发挥主要调控作用。我们认为，参与这一相互作用的分泌因子具有作为药物靶点的潜力。在本研究中，我们采用蛋白质组学引导的药物发现策略，利用肺成纤维细胞的分泌组，以揭示影响上皮祖细胞行为的药物靶点。利用肺类器官，我们鉴定出若干具有再生潜力的配体，其中基质蛋白骨甘氨酸（OGN）的效果出乎意料地最为显著。RNA测序显示，OGN促进肺泡II型上皮细胞分化，同时增强活性氧解毒、减少衰老，并增强生长因子介导的成纤维细胞-上皮细胞串扰。与此一致的是，OGN蛋白表达在COPD患者受损肺组织及烟雾暴露小鼠中降低。

此外，我们发现OGN的一个活性片段包含富含亮氨酸重复序列4-7区域，在调控肺类器官形成方面具有相当的再生潜力。OGN活性片段改善了精密切割肺切片（PCLS）中弹性蛋白酶诱导的肺损伤，并改善了小鼠的肺功能。这些发现表明，肺成纤维细胞来源的OGN是一种支持肺泡上皮生长的基质蛋白，其活性片段有望成为组织损伤加速个体上皮细胞修复的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。