脓毒症存活小鼠单核细胞重编程与个体发生改变增强脂多糖诱导肺损伤的ATAC-Seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE268368

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数据说明

脓毒症是感染相关住院的主要原因。脓毒症后持续性炎症与不良长期结局相关，包括因新的损伤性肺部疾病而再住院。既往感染可在免疫细胞及其祖细胞中引发持久的表观遗传改变，导致炎症重编程，但持续性免疫编程在介导脓毒症幸存者并发症中的作用仍不清楚。我们此前已证实，小鼠多微生物脓毒症存活与脂多糖诱导的肺损伤反应增强相关。这与肺内经典（Ly6Chi）单核细胞中细胞因子表达增强相关，提示单核细胞在脓毒症存活者肺损伤增强中发挥作用。我们在脓毒症后三周和三个月的小鼠中进行了单核细胞清除和过继转移。我们证实Ly6Chi单核细胞被持续重编程以增强肺损伤，并确定中性粒细胞脱颗粒为潜在机制。

脓毒症后三周，小鼠单核细胞显示出持续改变的转录和染色质改变，这些改变富集于TLR4、HIF1α和JAK-STAT信号通路及AP-1结合，与持续性免疫重编程一致。由于近期发现了新的Ly6Chi单核细胞亚群，但其功能相关性仍未知，我们评估了单核细胞亚群的存在及其与脓毒症和急性肺损伤的关联。据我们所知，我们首次证明脓毒症在小鼠和人类中引发单核细胞向粒细胞-单核细胞祖细胞来源的中性粒细胞样谱系的个体发育转变。这些数据提示，脓毒症存活者中改变的髓系生成可能预测不良长期结局；为此，我们证明单核细胞和中性粒细胞计数与90天死亡率相关，并在预测结局方面具有互补性。综上所述，这项工作支持一个概念模型，即既往脓毒症引发

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。