间质性肺疾病样本血液基因表达谱

资源简介

间质性肺疾病样本血液基因表达谱

GSE267652 是一项聚焦间质性肺疾病（interstitial lung disease, ILD）血液基因表达谱的公开数据集，来源于 NCBI。该数据集围绕 IPF、HP、SSc-ILD、IPAF 四类患者人群，提供了共 59 例样本、180 个基因的表达信息，并以芯片表达谱的形式组织。数据集仅包含 1 个文件，样例文件为 GSE267652_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩格式。整体来看，该数据集适合用于间质性肺疾病不同亚型之间血液转录层面的比较研究，也可作为呼吸系统疾病基因表达分析的基础数据资源。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

间质性肺疾病是一组以肺间质受累为主要特征的疾病总称，其不同亚型在临床表型、病程和预后上存在差异。血液基因表达谱能够从外周血层面反映机体在疾病状态下的转录活动，为区分不同亚型、探索潜在生物标志物提供线索。该数据集以血液样本为对象，覆盖 IPF（特发性肺纤维化）、HP（过敏性肺炎）、SSc-ILD（系统性硬化症相关间质性肺病）和 IPAF（具有自身免疫特征的间质性肺炎）患者，共 59 例，体现了在间质性肺疾病领域开展多亚型基因表达比较的研究背景。数据集在站内归类为呼吸系统疾病 / 其他，主题标签涉及 Expression profiling by array、GPL34482 和 9606，说明其采用芯片表达谱技术平台，物种为人。

【数据内容】

数据集的核心内容是间质性肺疾病样本的血液基因表达谱，具体为 180 个基因在 IPF、HP、SSc-ILD、IPAF 患者中的表达信息，样本总数为 59 例。数据以系列矩阵文件的形式提供，文件样例为 GSE267652_series_matrix.txt.gz，文件数量为 1。该文件通常以矩阵形式组织表达值，行与列分别对应基因和样本层面的信息，便于直接读取和后续分析。数据集的主题标签中包含 GPL34482，指向所使用的芯片平台；9606 对应人类物种标识。整体数据规模较为精简，聚焦于特定基因集合而非全转录组，适合针对性地考察这 180 个基因在四类间质性肺疾病患者血液中的表达差异。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 Blood gene expression profiling of interstitial lung disease samples，作者为 Daniel, He，发布时间为 May 16 202。数据通过芯片表达谱技术获得，主题标签中的 Expression profiling by array 表明其属于微阵列表达谱研究。样本覆盖 IPF、HP、SSc-ILD、IPAF 四类患者，合计 59 例。数据集以 GSE267652 编号发布，配套提供系列矩阵文件供下载使用。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、临床变量细节等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于间质性肺疾病不同亚型之间的血液基因表达比较分析，例如考察 IPF、HP、SSc-ILD、IPAF 患者在 180 个目标基因上的表达差异，探索亚型区分或疾病相关表达模式。也可作为呼吸系统疾病基因表达研究的辅助数据，用于候选基因筛选、表达谱聚类或与其他表达谱数据集的对照参考。由于数据聚焦于血液样本和特定基因集合，适合开展靶向性的验证性分析和小规模探索研究，而不适用于全转录组层面的广泛挖掘。具体的研究设计与分析目标需结合使用者自身需求确定。

【使用方法】

使用该数据集时，首先下载数据文件 GSE267652_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，读取前需先解压，再按文本矩阵格式解析，核对字段与编码方式。建议先在小样本上检查数据结构和编码是否正确，确认无误后再批量接入完整数据。分析时可结合主题标签中的平台信息 GPL34482 了解芯片注释背景，并将样本按 IPF、HP、SSc-ILD、IPAF 四类分组，围绕 180 个基因开展表达比较。由于文件数量仅为 1，数据接入流程相对简单，但仍应注意压缩包解压后的文件完整性校验。

【质量与限制】

该数据集样本量为 59 例，覆盖四类间质性肺疾病亚型，基因范围为 180 个，属于聚焦特定基因集合的表达谱数据，而非全转录组覆盖。数据文件数量为 1，以系列矩阵形式提供，使用前需解压并核对字段与编码。关于样本的临床特征、批次信息、质控指标、缺失值情况以及数据归一化处理细节，源站未提供。因此在使用时应对数据质量进行自行核查，并在结果解释中考虑样本量与基因覆盖范围的局限。此外，发布时间标注为 May 16 202，年份信息不完整，源站未提供更明确的说明。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Daniel, He，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集编号为 GSE267652。使用时应遵循来源站的相关使用条款并适当引用原数据集。关于具体的许可协议、使用限制以及推荐引用格式，源站未提供。