GSE260707：非经典Wnt信号与Notum介导气管发育间充质凝聚时间动态研究

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE260707

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数据说明

气管对于将空气正常输送至肺部以进行气体交换至关重要。常见的先天性气管畸形会影响软骨，导致呼吸周期中中心气道塌陷。我们已经证明，Notum作为一种Wnt配体脱酰酶，可减弱Wnt信号通路的经典分支，并且是软骨性间充质凝聚所必需的。在Notum缺陷的气管中，软骨生成延迟，气管狭窄。目前尚不清楚Notum是否减弱非经典Wnt信号。值得注意的是，在间充质中缺失非经典Wnt5a配体后，我们观察到气管软骨生成提前。我们假设Notum和Wnt5a是介导间充质凝聚及时形成所必需的，从而产生气管软骨。气管组织的离体培养显示，化学抑制Wnt非经典通路可促进凝聚提前，而抑制Notum则导致凝聚延迟。此外，非经典Wnt诱导可阻止软骨性间充质凝聚的形成。

另一方面，在间充质Wnt5a缺失的情况下，软骨母细胞之间的细胞-细胞相互作用增强。通过对Wnt5a和Notum缺陷气管中的基因表达进行无偏分析，我们检测到在Wnt5a突变体中，对软骨形成和细胞外基质形成至关重要的基因的mRNA在E11.5时上调。该表达谱支持在Wnt5a和Notum缺陷气管中观察到的提前和延迟的软骨形成。我们得出结论，Notum和Wnt5a通过协调及时的软骨形成，对于正常的气管软骨模式形成是必需的。因此，这些研究揭示了气管先天性异常背后的分子机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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