靶向IL1RAP联合抑制IL-1、IL-33和IL-36信号改善系统性硬化症临床前模型皮肤与肺纤维化
研究围绕IL1RAP作为IL-1、IL-33和IL-36受体共受体,在系统性硬化症(SSc)临床前模型中评估抗IL1RAP抗体联合抑制这些细胞因子的抗纤维化潜力,涉及cGvHD、博来霉素诱导真皮纤维化和拓扑异构酶-I诱导纤维化三种小鼠模型,并利用公共RNAseq数据挖掘和成像质谱流式分析IL1RAP

基本信息
资源简介
靶向IL1RAP联合抑制IL-1、IL-33和IL-36信号改善系统性硬化症临床前模型皮肤与肺纤维化
Combined inhibition of IL-1, IL-33 and IL-36 signaling by targeting IL1RAP ameliorates skin and lung fibrosis in preclinical models of Systemic Sclerosis
该数据集来自NCBI GEO(GSE255031),包含1个series matrix文件,主题为高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台GPL24247。研究围绕IL1RAP作为IL-1、IL-33和IL-36受体共受体,在系统性硬化症(SSc)临床前模型中评估抗IL1RAP抗体联合抑制这些细胞因子的抗纤维化潜力,涉及cGvHD、博来霉素诱导真皮纤维化和拓扑异构酶-I诱导纤维化三种小鼠模型,并利用公共RNAseq数据挖掘和成像质谱流式分析IL1RAP相关信号分子表达。数据可用于纤维化相关基因表达分析与靶点验证(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 04 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:IL-1受体辅助蛋白(IL1RAP)是IL-1、IL-33和IL-36受体信号传导所必需的共受体。在此,我们通过抗IL1RAP抗体联合抑制这些细胞因子,研究其抗纤维化潜力,为系统性硬化症(SSc)的临床开发提供科学依据。方法:通过挖掘公开可用的RNAseq数据以及成像质谱流式(IMC)确定IL1RAP相关信号分子的表达。在三种互补小鼠模型中确定治疗性给药抗IL1RAP抗体的疗效:慢性硬化性移植物抗宿主病(cGvHD)、博来霉素诱导的真皮纤维化模型和拓扑异构酶-I(topo)诱导的纤维化。结果:SSc皮肤在mRNA和蛋白质水平显示IL1RAP及IL1RAP相关信号分子上调
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE255031
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 30 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
背景:IL-1受体辅助蛋白(IL1RAP)是IL-1、IL-33和IL-36受体信号传导所必需的共受体。在此,我们研究通过抗IL1RAP抗体联合抑制这些细胞因子的抗纤维化潜力,为系统性硬化症(SSc)的临床开发提供科学依据。方法:通过挖掘公开可用的RNAseq数据以及成像质谱流式技术(IMC)确定IL1RAP相关信号分子的表达。在三种互补的小鼠模型中确定抗IL1RAP抗体治疗给药的疗效:慢性硬皮病样移植物抗宿主病(cGvHD)、博来霉素诱导的皮肤纤维化模型和拓扑异构酶-I(topo)诱导的纤维化。结果:与正常皮肤相比,SSc皮肤在mRNA和蛋白质水平上显示IL1RAP及IL1RAP相关信号分子的上调。IL-1、IL-33和IL-36均调控与SSc不同病理生理过程相关的不同基因集。在体外,人成纤维细胞和内皮细胞对IL-1、IL-33和IL-36的应答被抗IL1RAP抗体治疗完全阻断。
此外,抗IL1RAP抗体治疗减轻了cGvHD、博来霉素及拓扑异构酶诱导的纤维化模型中的皮肤和肺纤维化。重要的是,RNAseq分析显示,IL1RAP抑制对与炎症和纤维化相关的多个过程产生影响,而这些过程在人类SSc皮肤中也存在失调。结论:本研究首次为靶向IL1RAP治疗SSc提供了治疗益处的证据。我们的发现具有很高的转化潜力,因为抗IL1RAP抗体CAN10最近已进入1期临床试验。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




