25-羟基胆固醇通过重编程胆固醇代谢抑制汉坦病毒感染并提示他汀类药物作为候选汉坦病毒抑制剂

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个高通量测序表达谱文件,围绕 25-羟基胆固醇(25HC)及其合成酶 CH25H 抑制汉坦病毒(HTNV)感染的机制展开

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基因组预测GPL246769606
GSE252127: 25-Hydroxycholesterol inhibits hantavirus infection through reprogramming cholesterol metabolism and suggest statins as candidate hantavirus inhibitors

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-30

资源简介

25-羟基胆固醇通过重编程胆固醇代谢抑制汉坦病毒感染并提示他汀类药物作为候选汉坦病毒抑制剂

25-Hydroxycholesterol inhibits hantavirus infection through reprogramming cholesterol metabolism and suggest statins as candidate hantavirus inhibitors

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个高通量测序表达谱文件,围绕 25-羟基胆固醇(25HC)及其合成酶 CH25H 抑制汉坦病毒(HTNV)感染的机制展开。数据覆盖感染细胞中 CH25H 的诱导表达以及 25HC 处理后的转录组变化,可用于分析胆固醇代谢重编程与抗病毒反应的关系,并探索他汀类药物作为候选汉坦病毒抑制剂的潜力(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):汉坦病毒引起两种急性疾病:肾综合征出血热(HFRS)和汉坦病毒肺综合征(HPS),由于高死亡率和缺乏有效治疗,它仍然是一个主要的健康问题。干扰素仅在非常早期阶段有效抑制汉坦病毒感染。几种干扰素刺激基因(ISGs)已被表明可抑制汉坦病毒感染。胆固醇25-羟化酶(CH25H)已被表明是一种ISG,其编码一种催化25-羟基胆固醇(25HC)产生的酶。25HC在调节胆固醇生物合成和抑制多种包膜病毒感染中起重要作用。在这里,我们显示汉滩病毒(HTNV),汉坦病毒的原型,在感染细胞中诱导CH25H。CH25H的过表达及其酶产物25HC的处理均抑制HTNV感染,可能通过低

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE252127

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 27 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

汉坦病毒可引起两种急性疾病:肾综合征出血热(HFRS)和汉坦病毒肺综合征(HPS),由于其高死亡率和缺乏有效治疗手段,仍是重要的公共卫生问题。干扰素仅在极早期阶段对抑制汉坦病毒感染有效。多种干扰素刺激基因(ISGs)已被证实可抑制汉坦病毒感染。胆固醇25-羟化酶(CH25H)已被确认为一种ISG,其编码的酶催化25-羟基胆固醇(25HC)的生成。25HC在调节胆固醇生物合成中发挥重要作用,并可抑制多种包膜病毒感染。本研究表明,汉滩病毒(HTNV)——汉坦病毒的原型株——可诱导感染细胞中CH25H的表达。CH25H的过表达及其酶促产物25HC的处理均能抑制HTNV感染,其机制可能通过下调3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶调控(HMG-CoA还原酶,HMGCR)从而抑制胆固醇合成。此外,降胆固醇药物——靶向HMGCR的他汀类药物——具有强效的汉坦病毒抑制效果。

综上所述,我们的结果表明,25HC和他汀类药物是潜在的抗汉坦病毒感染的抗病毒药物。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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