健康与囊性纤维化人气道上皮细胞培养中RSV感染时间进程
该数据集来自NCBI GEO，记录健康与囊性纤维化（CF）人气道上皮细胞培养在呼吸道合胞病毒（RSV）感染后的时间进程。研究目的是观察感染后不同时间点基因表达的变化，数据以高通量测序表达谱形式提供，包含一个系列矩阵文件
基本信息
资源简介
健康与囊性纤维化人气道上皮细胞培养中RSV感染时间进程
GSE247298 数据集来自 NCBI GEO，主题为健康与囊性纤维化（CF）人气道上皮细胞培养在呼吸道合胞病毒（RSV）感染后的时间进程。研究目的是观察感染后不同时间点基因表达的变化，数据以高通量测序表达谱形式提供，包含一个系列矩阵文件。该数据集归入呼吸系统疾病 / 其他分类，由 Jennifer A. Bartlett 提交，发布时间为 Nov 08 202，可用于了解 RSV 感染在健康与 CF 气道上皮中的转录组动态。
【数据集背景】
呼吸道合胞病毒（RSV）是常见的呼吸道病原体，而囊性纤维化（CF）是一种影响气道上皮功能的遗传性疾病。该研究关注健康与 CF 人气道上皮细胞培养在 RSV 感染后的时间进程，目的在于考察感染后不同时间点基因表达的变化。数据集标题明确指向“健康与囊性纤维化（CF）人气道上皮细胞培养中 RSV 感染的时间进程”，源站描述也说明研究目标是检查感染 RSV 后健康与 CF 人气道上皮随时间发生的基因表达变化。该数据集在本站分类中归入呼吸系统疾病 / 其他，主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301 和 9606。
【数据内容】
数据集以高通量测序表达谱形式提供，文件数量为 1，文件样例为 GSE247298_series_matrix.txt.gz。该文件为系列矩阵文件，通常用于承载表达谱数据的矩阵化结果。主题标签中的 GPL20301 和 9606 分别对应平台与物种相关信息，9606 对应人类。数据内容围绕健康与 CF 人气道上皮细胞培养在 RSV 感染后的时间进程展开，具体样本数量、时间点设置、分组细节以及矩阵中的字段构成，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI GEO 数据库。作者为 Jennifer A. Bartlett，发布时间为 Nov 08 202。源站标题与数据集英文名一致，均为“Time course of respiratory syncytial virus (RSV) infection in healthy and cystic fibrosis (CF) human airway epithelial cell cultures”。源站描述说明研究目的是检查健康与 CF 人气道上皮感染 RSV 后随时间变化的基因表达。除上述信息外，样本采集地点、伦理审批信息、测序平台的具体型号与试剂细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究 RSV 感染后人气道上皮细胞培养的基因表达时间进程，尤其适合比较健康与囊性纤维化（CF）气道上皮在感染后的转录组变化。由于数据以高通量测序表达谱形式提供，可用于表达谱层面的差异分析、时间序列趋势观察以及健康与 CF 两组之间的对照研究。主题标签中的 Expression profiling by high throughput sequencing 表明其属于高通量测序表达谱数据。具体可支持的统计方法、样本量是否满足特定分析需求，源站未提供。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE247298_series_matrix.txt.gz，按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。由于数据集仅包含一个系列矩阵文件，使用时应以该文件为主要数据入口，结合源站标题与描述理解其时间进程与分组设计。关于矩阵文件中的具体列名、注释信息、是否需要额外平台注释文件，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集文件数量为 1，数据以系列矩阵形式提供，使用前需核对字段与编码。发布时间为 Nov 08 202，具体年份信息在源站记录中未完整呈现。样本数量、时间点数量、重复设置、测序深度、数据预处理方法以及质控指标，源站未提供。由于缺少这些细节，无法依据现有信息评估数据的具体质量水平或适用范围边界。使用时应注意仅基于文件内容与源站描述进行判断，避免超出数据实际覆盖范围进行推断。
【引用与许可】
作者为 Jennifer A. Bartlett，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。引用时应参考源站标题“Time course of respiratory syncytial virus (RSV) infection in healthy and cystic fibrosis (CF) human airway epithelial cell cultures”以及数据集编号 GSE247298。关于该数据集的许可条款、使用限制与正式引用格式，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE247298
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在探究感染RSV后，健康人气道上皮与囊性纤维化（CF）人气道上皮随时间变化的基因表达变化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
