囊性纤维化中培养鼻与支气管上皮内在变异性的表达谱研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE241801

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

鼻腔和支气管上皮是呼吸道的统一组成部分，在单基因疾病囊性纤维化（CF）中均受累。近期研究发现，鼻腔和支气管组织存在内在变异性，包括黏液纤毛细胞组成差异以及与胚层起源相关的独特转录调控蛋白表达差异。在本研究中，我们探索了CF患者培养的鼻腔和支气管上皮细胞之间的转录组差异。对CF受试者气液界面分化的上皮细胞进行比较，揭示了鼻腔和支气管培养物具有不同的黏液纤毛分化状态。此外，利用RNA测序，我们在分化的鼻腔和支气管上皮细胞中鉴定了细胞类型特异性特征转录因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。