人类血液、扁桃体、肺和小肠先天淋巴细胞scRNAseq

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240441

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

1型先天淋巴细胞（ILC1）是缺乏抗原特异性受体的细胞毒性淋巴细胞，可产生干扰素γ，包括ILC1和自然杀伤（NK）细胞。在小鼠中，ILC1与NK细胞不同，其发育独立于NK细胞特异性转录因子EOMES，但需要抑制因子ZFP683（人类为ZNF683）以维持组织驻留。本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究人类ILC1的多样性，鉴定了跨组织高度可变的ILC1亚型。肠上皮含有丰富的成熟EOMES− ILC1，其表达PRDM1而非ZNF683，同时存在少量未成熟的TCF7+PRDM1− ILC1。其他组织含有表达ZNF683和EOMES转录本的NK细胞；然而，EOMES蛋白含量存在差异。这些ZNF683+ NK细胞是组织印记的NK细胞，表型上类似于ILC1。组织ILC1-NK谱还包括常规NK细胞和以PTGDS表达为特征的NK细胞。这些发现为评估疾病中NK-ILC1谱系的表型和功能变化奠定了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。