淋巴滤泡空间转录组揭示COPD肺气肿特异性B细胞特征
研究识别出19例具有三级淋巴结构（TLS）的患者，其中13例COPD、6例SC，最终115个TLS数据用于分析。数据可用于探索COPD肺气肿相关B细胞特征及淋巴滤泡的空间转录组研究（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
淋巴滤泡空间转录组揭示COPD肺气肿特异性B细胞特征
Lymphoid Follicle Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-Specific B Cell Signature in COPD
该数据集来自NCBI GEO，采用Geomx Digital Space Profiling方法对48例患者的石蜡包埋和OCT包埋肺切片进行WTA RNA转录组分析，样本包括从不吸烟对照（NSC，n=8）、吸烟对照（SC，n=13）和COPD GOLD1-4患者（n=27）。研究识别出19例具有三级淋巴结构（TLS）的患者，其中13例COPD、6例SC，最终115个TLS数据用于分析。数据可用于探索COPD肺气肿相关B细胞特征及淋巴滤泡的空间转录组研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jul 12 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：采用Geomx的Digital Space Profiling方法对肺三级淋巴结构（TLS，滤泡）进行WTA RNA转录组分析，我们评估了48例患者的石蜡包埋和OCT包埋肺切片，这些患者被分类为从不吸烟对照（NSC，n=8）、吸烟对照（SC，n=13）和COPD GOLD1-4患者（n=27例）。我们识别出19例具有三级淋巴结构（TLS）的患者，分布为13例COPD患者和6例SC受试者，最终有115个TLS数据用于最终数据分析。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL18573、9606。本站分类：呼吸系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE237120
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 14 202，引用时请注意版本时效。
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE237120
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们采用Geomx的数字空间分析方法进行WTA RNA转录组学研究，针对肺三级淋巴结构（TLS，滤泡），评估了48例患者的石蜡包埋和OCT包埋肺切片，这些患者被分类为从不吸烟对照组（NSC，n=8）、吸烟对照组（SC，n=13）和COPD GOLD1-4期患者（n=27例）。我们识别出19例具有三级淋巴结构（TLS）的患者，分布为13例COPD患者和6例SC受试者，最终数据分析使用了115个TLS数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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