巨噬细胞CFTR功能缺失改变细胞转录程序并延迟肺部炎症消退

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,包含 1 个文件(GSE233733_series_matrix.txt.gz),对巨噬细胞特异性囊性纤维化(Mac-CF)小鼠与同源野生型(WT)小鼠在铜绿假单胞菌(PsA)感染后 1、3、5 天的肺灌洗细胞进行单细胞 RNA 测序分析,比较全局基因

geo
浏览 10
基因组分类GPL3017210090
GSE233733: Loss of CFTR Function in Macrophages Alters the Cell Transcriptional Program and Delays Lung Resolution of Inflammation

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

巨噬细胞CFTR功能缺失改变细胞转录程序并延迟肺部炎症消退

Loss of CFTR Function in Macrophages Alters the Cell Transcriptional Program and Delays Lung Resolution of Inflammation

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,包含 1 个文件(GSE233733_series_matrix.txt.gz),对巨噬细胞特异性囊性纤维化(Mac-CF)小鼠与同源野生型(WT)小鼠在铜绿假单胞菌(PsA)感染后 1、3、5 天的肺灌洗细胞进行单细胞 RNA 测序分析,比较全局基因转录差异。结果提示巨噬细胞中 CFTR 功能缺失改变细胞转录程序,主要影响线粒体呼吸、免疫应答和细胞抗氧化系统,可用于研究 CFTR 功能缺失如何影响细胞稳态及感染应答(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 30 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究对巨噬细胞特异性囊性纤维化(Mac-CF)小鼠和同源野生型(WT)小鼠的肺灌洗细胞进行了单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)分析,这些小鼠已被铜绿假单胞菌(PsA)攻击不同时间点(1、3 和 5 天)。研究询问并比较了全局基因转录的差异。结果表明,巨噬细胞中 CFTR 功能缺失改变了细胞转录程序,主要影响线粒体呼吸、免疫应答和细胞抗氧化系统。因此,巨噬细胞中 CFTR 功能缺失影响细胞稳态,导致对感染的细胞应答失调,这可能加剧 CF 肺病。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL30172、10090。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE233733

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 14 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE233733

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究对巨噬细胞特异性囊性纤维化(Mac-CF)小鼠及同类系野生型(WT)小鼠的肺灌洗细胞进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析,这些小鼠分别在不同时间点(1、3和5天)接受了铜绿假单胞菌(PsA)攻击。研究对整体基因转录差异进行了探究和比较。结果表明,巨噬细胞中CFTR功能缺失改变了细胞转录程序,主要影响线粒体呼吸、免疫反应和细胞抗氧化系统。因此,巨噬细胞中CFTR功能缺失影响细胞稳态,导致对感染的细胞反应失调,这可能加重CF肺病。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。