机械张力诱导肺再生过程中血管生成的空间控制 [RNA-seq 数据集 II]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE230412

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

单侧肺切除（PNX）后力学改变调控肺切除后的肺生长。本研究表明，肺切除后小鼠肺外周区域的血管形成通过黏着斑蛋白桩蛋白（paxillin）受到刺激，而抑制机械张力则减弱这一效应。肺切除后，桩蛋白在内皮细胞（ECs）和肺泡上皮2型（AT2）细胞中的表达增加，进而上调内皮细胞中的血管生成因子血管生成素-2（Ang2）和AT2细胞中的Ang1，从而决定外周区域的血管形成。肺切除后小鼠肺外周区域增殖的一般毛细血管内皮细胞增多。影响细胞机械反应的细胞外基质蛋白在肺切除后小鼠肺中呈特异性差异表达，其驱动桩蛋白表达，导致小鼠肺外周区域的血管形成。这些结果表明，内皮细胞和AT2细胞中机械敏感信号的协同作用介导了再生性肺生长过程中血管形成的空间调控。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。