NS1缺失流感病毒载体鼻内COVID-19疫苗抑制SARS-CoV-2炎症反应（小鼠肺泡巨噬细胞ATAC-seq数据）
该数据集为GSE227648，包含小鼠肺泡巨噬细胞（AMs）的ATAC-seq数据，用于研究NS1缺失流感病毒载体鼻内COVID-19疫苗（dNS1-RBD）诱导的免疫保护机制
基本信息
资源简介
NS1缺失流感病毒载体鼻内COVID-19疫苗抑制SARS-CoV-2炎症反应（小鼠肺泡巨噬细胞ATAC-seq数据）
Intranasal delivery of NS1-deleted influenza virus vectored COVID-19 vaccine restrains the SARS-CoV-2 inflammatory response (Mouse AMs ATAC-seq Data)
该数据集为GSE227648，包含小鼠肺泡巨噬细胞（AMs）的ATAC-seq数据，用于研究NS1缺失流感病毒载体鼻内COVID-19疫苗（dNS1-RBD）诱导的免疫保护机制。数据源自NCBI GEO，共1个文件，主题涉及基因组结合/占据谱分析。该疫苗可诱导先天免疫、训练免疫及上下呼吸道组织驻留记忆T细胞，并通过抑制SARS-CoV-2攻击后早期病毒载量和降低促炎细胞因子（IL-6、IL-1B、IFN-γ）水平来限制炎症反应。该数据可用于分析染色质可及性变化，探索疫苗介导的广谱呼吸道保护的表观遗传调控机制（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Mar 19 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：SARS-CoV-2（严重急性呼吸综合征冠状病毒-2）变异株的出现及“解剖逃逸”特性威胁当前冠状病毒病（COVID-19）疫苗的有效性。迫切需要了解广谱呼吸道保护的免疫机制，以指导更广泛疫苗的开发。在本研究中，我们研究了NS1缺失流感病毒载体鼻内COVID-19疫苗（dNS1-RBD）诱导的免疫反应，该疫苗提供针对SARS-CoV-2变异株的广谱保护。鼻内递送dNS1-RBD诱导了先天免疫、训练免疫以及覆盖上下呼吸道的组织驻留记忆T细胞。它通过抑制SARS-CoV-2攻击后的早期病毒载量和减弱促炎细胞因子（IL-6、IL-1B和IFN-γ）水平来限制炎症反应。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24247、10090。本站分类：呼吸系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE227648
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 12 202，引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
The emergence of SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2) variants and “anatomical escape” characteristics threaten the effectiveness of current coronavirus disease (COVID-19) vaccines. There is an urgent need to understand the immunological mechanism of broad-spectrum respiratory tract protection to guide broader vaccines development. In this study, we investigated immune responses induced by an NS1-deleted influenza virus vectored intranasal COVID-19 vaccine (dNS1-RBD) which provides broad-spectrum protection against SARS-CoV-2 variants. Intranasal delivery of dNS1-RBD induced innate immunity, trained immunity and tissue-resident memory T cells covering the upper and lower respiratory tract. It restrained the inflammatory response by suppressing early phase viral load post SARS-CoV-2 challenge and attenuating pro-inflammatory cytokine (IL-6, IL-1B, and IFN-γ) levels, thereby reducing excess immune-induced tissue injury compared with the control group. By inducing local cellular immunity and trained immunity, intranasal delivery of NS1-deleted influenza virus vectored vaccine represents a broad-spectrum COVID-19 vaccine strategy to reduce disease burden. To investigate the trainned-immunity of alveolar macrophage generated by dNS1-RBD vaccine in C57BL/6 mouse, we vaccinated C57BL/6 mice with dNS1-RBD/dNS1-Vector/PBS and collect the alveolar macrophage samples to sequence for the ATAC-seq data 2 months post vaccinated. Then performed the differential peak and igv track visualization with this dataset.
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
