GSE227210：α1-抗胰蛋白酶缺乏症中的肺部功能获得性毒性
研究聚焦 α1-抗胰蛋白酶缺乏症（ZZ-AATD）中的肺部功能获得性毒性，发现 AAT 在原发性人肺组织的肺泡巨噬细胞及肺泡2型细胞中表达，ZZ-AATD 的 AT2 与肺泡巨噬细胞呈现炎症通路和未折叠蛋白反应基因集富集的转录组特征，AT2 还显示 ATF4 调控子富集及 cleaved caspa
基本信息
资源简介
GSE227210：α1-抗胰蛋白酶缺乏症中的肺部功能获得性毒性
Pulmonary gain-of-function toxicity in alpha-1 antitrypsin deficiency
该数据集来自 NCBI GEO，包含 1 个文件 GSE227210_series_matrix.txt.gz，主题为高通量测序表达谱分析，物种为人类（9606），平台为 GPL24676。研究聚焦 α1-抗胰蛋白酶缺乏症（ZZ-AATD）中的肺部功能获得性毒性，发现 AAT 在原发性人肺组织的肺泡巨噬细胞及肺泡2型细胞中表达，ZZ-AATD 的 AT2 与肺泡巨噬细胞呈现炎症通路和未折叠蛋白反应基因集富集的转录组特征，AT2 还显示 ATF4 调控子富集及 cleaved caspase 3 表达等细胞应激证据。数据可用于探索 ZZ-AATD 肺气肿发病机制及表达谱分类研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Mar 13 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：总体而言，我们发现 AAT 在原发性人肺组织中除肺泡巨噬细胞外还表达于肺泡2型细胞。ZZ-AATD 中的 AT2 和肺泡巨噬细胞表现出独特的转录组特征，包括炎症通路和未折叠蛋白反应基因集富集。ZZ-AATD 中的 AT2 还表现出细胞应激的证据，包括 ATF4 调控子富集和 cleaved caspase 3 的表达。总之，这些发现扩展了 ZZ-AATD 中肺气肿发病机制的现有范式，并提示表达 AAT 的常驻肺细胞可作为未来研究的合理治疗靶点。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE227210
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 13 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE227210
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
总体而言，我们发现AAT在原代人肺组织中除肺泡巨噬细胞外，还表达于肺泡2型细胞。ZZ-AATD中的AT2细胞和肺泡巨噬细胞表现出独特的转录组特征，包括炎症通路和未折叠蛋白反应基因集的富集。ZZ-AATD中的AT2细胞还表现出细胞应激的证据，包括ATF4调节子富集和切割型caspase 3的表达。总之，这些发现拓展了ZZ-AATD中肺气肿发病机制的现有范式，并提示表达AAT的常驻肺细胞可作为未来研究的合理治疗靶点。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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