纤毛细胞Fzd6缺失抑制LPS与冠状病毒诱导的铁死亡肺泡细胞死亡(RNA-seq子集II)
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE222753的RNA-seq子集II,聚焦纤毛细胞中Fzd6缺失对LPS或小鼠冠状病毒MHV-1诱导的肺损伤及铁死亡性肺泡细胞死亡的影响
![GSE222753: Lack of Fzd6 in Ciliated Cells Suppresses Ferroptotic Alveolar Cell Death induced by LPS and Corona Virus [RNA-seq subset II]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/142763.jpg)
基本信息
资源简介
纤毛细胞Fzd6缺失抑制LPS与冠状病毒诱导的铁死亡肺泡细胞死亡(RNA-seq子集II)
Lack of Fzd6 in Ciliated Cells Suppresses Ferroptotic Alveolar Cell Death induced by LPS and Corona Virus [RNA-seq subset II]
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE222753的RNA-seq子集II,聚焦纤毛细胞中Fzd6缺失对LPS或小鼠冠状病毒MHV-1诱导的肺损伤及铁死亡性肺泡细胞死亡的影响。数据包含1个文件(GSE222753_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为GPL19057。可用于研究Fzd6缺失、Akr1b8表达上调及铁死亡抑制剂在急性肺损伤和ARDS相关机制中的作用(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 12 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):肺部炎症损害肺屏障功能,是包括急性肺损伤和急性呼吸窘迫综合征(ARDS)在内的多种肺部疾病的基础。然而,肺细胞对炎症损伤所致损伤的反应机制尚未完全清楚。在此我们显示,在受LPS或小鼠冠状病毒MHV-1损伤的肺中,Foxj1+纤毛细胞中Fzd6缺陷可降低肺通透性、脂质过氧化和肺泡细胞死亡,并伴随肺泡数量增加。肺细胞单细胞RNA测序表明,Fzd6(主要表达于Foxj1+纤毛细胞)的缺失增加了醛酮还原酶Akr1b8的表达。气管内给予Akr1b8蛋白可重现Fzd6缺陷肺表型。此外,铁死亡抑制剂也可重现Fzd6缺陷肺表型,并exer
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL19057、10090。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE222753
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 01 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE222753
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
肺部炎症会损害肺屏障功能,并且是包括急性肺损伤和急性呼吸窘迫综合征(ARDS)在内的多种肺部疾病的基础。然而,肺细胞对炎症损伤所引起损害的反应机制尚未完全明了。本研究表明,在LPS或小鼠冠状病毒MHV-1损伤的肺中,Foxj1+纤毛细胞中Fzd6的缺失可降低肺通透性、脂质过氧化和肺泡细胞死亡,同时伴随肺泡数量增加。肺细胞的单细胞RNA测序表明,Fzd6(主要表达于Foxj1+纤毛细胞)的缺失会增加醛酮还原酶Akr1b8的表达。气管内给予Akr1b8蛋白可重现Fzd6缺失的肺表型。此外,铁死亡抑制剂也可重现Fzd6缺失的肺表型,且在Fzd6缺失的肺中不产生进一步效应。
这些结果表明,Fzd6缺陷通过释放Akr1b8抑制炎症诱导的肺泡细胞铁死亡,从而揭示了一种此前未知的机制,即Fzd6信号通过旁分泌途径调控铁死亡。此外,本研究还证明了纤毛细胞在肺部炎症过程中保护肺泡细胞方面尚未被充分认识的重要性。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




