局部润肤剂对小鼠模型特应性皮炎及特应性进程的影响

该数据集来自 NCBI GEO(GSE222019),研究局部润肤剂对慢性特应性皮炎(AD)小鼠模型中特应性进程的影响。实验将小鼠分为三组,分别单独使用局部卡泊三醇和卵清蛋白,或联合含亚油酸-神经酰胺的润肤剂处理,28 天后对皮肤病变、肺和血清进行临床、组织学和转录组分析

geo
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基因组预测GPL2424710090
GSE222019: Effect of topical emollient on the development of atopic dermatitis and atopic march in a mice model

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

局部润肤剂对小鼠模型特应性皮炎及特应性进程的影响

Effect of topical emollient on the development of atopic dermatitis and atopic march in a mice model

该数据集来自 NCBI GEO(GSE222019),研究局部润肤剂对慢性特应性皮炎(AD)小鼠模型中特应性进程的影响。实验将小鼠分为三组,分别单独使用局部卡泊三醇和卵清蛋白,或联合含亚油酸-神经酰胺的润肤剂处理,28 天后对皮肤病变、肺和血清进行临床、组织学和转录组分析。数据包含 1 个文件(GSE222019_series_matrix.txt.gz),可用于分析润肤剂对 AD 相关基因表达及肺部 Th2/嗜碱性粒细胞相关基因的影响(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 02 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):为了研究润肤剂对慢性特应性皮炎(AD)小鼠模型中特应性进程的影响。小鼠被分为3组,分别单独使用局部卡泊三醇和卵清蛋白,或联合含亚油酸-神经酰胺的润肤剂处理。28天后,对皮肤病变、肺和血清进行临床、组织学和转录组分析。卡泊三醇联合卵清蛋白诱导了典型的AD模型,同时肺部Th2和嗜碱性粒细胞相关基因表达增加。与AD组相比,润肤剂组:1)皮肤:临床严重程度和炎症细胞浸润显著减少,转录组分析显示AD相关基因显著下调(1450个差异表达基因(DEGs)中的286个),包括与先天炎症相关的基因(S100a8/a9、Il1b、Defb3/6、Mmp12)、趋化因子(Cxcl1/3、Ccl3/4)和 barr

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE222019

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 29 202,引用时请注意版本时效。

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数据说明

本研究旨在探讨润肤剂对慢性特应性皮炎(AD)小鼠模型中特应性进程的影响。小鼠分为3组,分别单独局部外用卡泊三醇和卵清蛋白,或联合含亚油酸-神经酰胺的润肤剂治疗。28天后,对皮肤病变、肺和血清进行临床、组织学和转录组学分析。卡泊三醇联合卵清蛋白诱导了典型的AD模型,同时肺部Th2和嗜碱性粒细胞相关基因表达增加。与AD组相比,润肤剂组:1)皮肤:临床严重程度和炎症细胞浸润显著减轻,转录组学分析显示AD相关基因显著下调(1450个差异表达基因(DEGs)中的286个),包括与先天炎症相关的基因(S100a8/a9、Il1b、Defb3/6、Mmp12)、趋化因子(Cxcl1/3、Ccl3/4)和屏障相关基因(Krt2/6b/80、Serpinb12、Lce3e、Sprr2)。KEGG分析显示,润肤剂下调的DEGs富集于线粒体OXPHOS相关通路,而上调的DEGs主要富集于轴突导向、紧密连接。

  1. 血清:总IgE和TSLP水平显著降低,IL-4水平呈下降趋势。3) 肺:275个上调差异表达基因中有187个在肺组织中显著下调,包括参与细胞因子与细胞因子受体相互作用的基因(Cxcl2/Cxcr2、Ccl2/3、Csf3r等)以及嗜碱性粒细胞活化的基因(Mcpt8、Cd200r3、Ms4a2)。因此,局部润肤剂不仅通过抑制线粒体呼吸链减轻皮肤炎症并维持皮肤屏障稳态,还通过降低TSLP和IgE水平限制全身性炎症。此外,它还能减少呼吸道趋化因子的产生以及嗜碱性粒细胞的浸润和活化,为阻断特应性进程提供了分子基础。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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