ILC2发育在谱系定向后需要GATA3相关超级增强子

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE218155

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本SuperSeries由下列SubSeries组成。2型固有淋巴细胞（ILC2）是固有淋巴细胞的一个亚群，可产生2型细胞因子，包括IL-4、IL-5和IL-13。GATA3是ILC2在多个阶段发育过程中的关键转录因子。然而，GATA3在何时以及如何被诱导至ILC2发育所需水平仍不清楚。在此，我们鉴定了ILC2特异性的串联GATA3相关超级增强子（G3SE），其在ILC2定向祖细胞中诱导高水平的GATA3。G3SE缺陷小鼠在骨髓、肺、肝和小肠中表现出ILC2缺失，ILC1略有增加，而ILC3、LTi、NK细胞及Th2细胞均无差异。单细胞RNA测序显示，晚期ILC2定向祖细胞中GATA3的诱导依赖于G3SE，并且是向成熟ILC2转变所必需的。Cnot6l是CCR4-Not去腺苷酸酶复合体的组成部分，可能是ILC2发育过程中GATA3的靶标。我们的发现揭示了ILC2发育过程中GATA3表达的一种新型调控机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。