LPS与盐水组及内皮Fgfr1条件敲除小鼠肺内皮细胞Bulk RNA-seq分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE216635

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

内皮细胞（ECs）作为半透性屏障，在急性肺损伤（ALI）/急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中发挥关键作用。众所周知，成纤维细胞生长因子受体1（FGFR1）是维持血管完整性所必需的。然而，内皮FGFR1在ALI/ARDS中如何发挥功能仍不清楚。在此，我们进行了RNA-seq分析，以研究生理盐水组与LPS组、WT（Fgfr1loxp/loxp）与内皮Fgfr1条件性敲除小鼠（Fgfr1iΔEC/iΔEC小鼠）之间ECs的转录变化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。