ATF3促进急性肺损伤中内皮细胞应答

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE213475

标准获取流程：

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数据说明

急性损伤后，肺内毛细血管床必须修复，以重建衬覆于这些血管的肺内皮细胞（ECs）与肺泡上皮之间的气体交换。然而，控制内皮细胞应激反应并驱动肺毛细血管再生的因素仍未被完全了解。流感、COVID-19等病毒感染可能通过丧失上皮气体交换伙伴或通过浸润免疫细胞的信号传导间接损伤肺血管系统。为防止过度组织损伤并更新内皮，内皮细胞必须在损伤后既承受细胞应激又进行增殖。在此，我们证明转录因子及即刻早期基因Atf3对流感感染后小鼠肺内的这两种反应均至关重要。Atf3表达界定了一个毛细血管内皮细胞亚群，该亚群富集参与细胞应激反应、血管生成和血管发育的基因。

内皮细胞中ATF3的缺失导致肺泡再生缺陷：在缺乏ATF3的情况下，内皮细胞表现为凋亡增加和增殖减少，从而形成类似肺气肿的表型，其特征为肺泡气腔扩大，且其衬覆区域伴有血管丢失。这些数据表明，ATF3是急性肺损伤后血管反应的重要组成部分，而该反应对于成功的肺再生是必需的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。