慢性应激靶向C57BL/6小鼠骨骼肌线粒体呼吸效率[Methylome数据集]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE210509

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性应激可导致细胞代谢失调，进而引发包括抑郁症、创伤后应激障碍在内的严重疾病，以及代谢综合征和2型糖尿病。我们旨在确定应激对肌肉组织能量代谢的急性和适应性影响，因为肌肉组织是全身能量消耗的主要决定因素。C57Bl6小鼠在15天的慢性可变应激（Cvs）下，尽管能量摄入增加，但瘦体重却减少。这伴随着能量消耗（EE）的降低，并根据昼夜节律发生底物利用的转变。多组学方法的结合排除了应激对腓肠肌转录和甲基化过程的影响。然而，Cvs干扰了线粒体中代谢成分的蛋白质组组成的改变，而OXPHOS和结构相关成分则未发生变化。

在功能上，Cvs导致复杂的独立线粒体电子流受损及耦合效率降低，这与复合体I的氧化磷酸化（状态3）与日间能量消耗（EE）相关，以及复合体II的最大解偶联呼吸（状态3u）与日间和夜间EE减少有关。线粒体的生物能量学评估显示，Cvs肌肉中的最优热力学效率（ƞ-opt）较高。结论：这些结果表明，Cvs引起的线粒体呼吸减少与总EE率低有关，但主要不影响肌肉中的转录和基因组甲基化。然而，通过增加复合体II效率的反向调节可能是推动纵向代谢变化的力量，作为肌肉生理适应的压力记忆基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。