COPD基底细胞向分泌细胞至多纤毛细胞失衡启动并增强环境应激韧性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE208662

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数据说明

引言：环境污染物刺激并损伤支气管纤毛清除系统，从而促进慢性阻塞性肺疾病（COPD）的疾病进展。上皮细胞对环境纳米颗粒的耐受机制在健康与疾病状态下的特征尚不明确。方法：我们研究了碳纳米颗粒和氧化锌纳米颗粒等常见污染物对终末期COPD、早期疾病及肺部健康个体的原代人支气管上皮细胞（pHBEC）的细胞功能及子代细胞的影响。在气液界面条件下将pHBEC暴露于纳米颗粒后，通过功能检测以及转录组和蛋白质分析对细胞培养物进行表征，并结合pHBEC培养系列样本中聚焦于基底细胞分化的单细胞分析。结果：在终末期COPD中，环境相关剂量的氧化锌纳米颗粒（ZnO）加剧了促分泌表型，同时以牺牲多纤毛上皮为代价，并伴有屏障完整性降低和对细胞损伤耐受性增加。

早期阶段COPD pHEBC培养物与香烟烟雾提取物共处理也诱导了相似的细胞组成和功能效应。时间分辨单细胞转录组学揭示了一种独特的终末期COPD相关基底细胞状态，其特征是Wnt和Notch通路激活的改变。一组保守的COPD特异性基因从这种疾病相关基底细胞状态持续存在于其分化子代中。结论：我们识别了基底干细胞中COPD阶段特异性基因程序的改变，这些改变影响支气管升降器的细胞组成，并可能控制上皮对环境纳米颗粒的弹性机制。所识别的现象可能为治疗或预防策略提供信息。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。