GSE203483：分泌型真菌效应蛋白通过Toll样受体4触发过敏性炎症以促成致死性感染

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE203483

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数据说明

侵袭性真菌病原体是人类死亡和发病的主要原因1,2。虽然在致病细菌中已鉴定出众多通过重编程先天免疫来促进毒力的分泌效应蛋白，但人类真菌病原体产生的类似分泌效应蛋白尚无先例。新型隐球菌是真菌性脑膜炎最常见的病因，也是艾滋病的主要致病菌，它诱导以肺部嗜酸性粒细胞增多和替代性活化巨噬细胞为特征的致病性2型反应3-8。在此，我们鉴定出Cpl1是新型隐球菌分泌的一种效应蛋白，它驱动巨噬细胞的替代性活化（也称为M2极化）以实现肺部感染。我们观察到，Cpl1增强的巨噬细胞极化需要Toll样受体4，该受体最为人熟知的是作为细菌内毒素的受体，但也是过敏原诱导2型反应的一种了解甚少的介质9-12。我们证明这种效应是由Cpl1本身而非脂多糖污染所致。Cpl1对毒力至关重要，在体内驱动间质巨噬细胞的极化，并且其对感染性的影响需要2型细胞因子信号传导。

值得注意的是，新型隐球菌在感染过程中选择性地与极化的间质巨噬细胞相关联，这提示了新型隐球菌在宿主体内建立其自身细胞内复制生态位的一种机制。本研究揭示了一条新的回路，即人类真菌病原体产生的一种分泌效应蛋白能够重编程先天免疫，从而揭示了Toll样受体4在感染性疾病发病机制中出人意料的作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。