GSE200587：利用bulk和单细胞RNA测序解析肺气肿肺组织中性别依赖的树突状细胞-单核细胞谱系

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE200587

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺气肿是慢性阻塞性肺疾病的一种独特类型，性别可能影响其易感性。暴露于香烟烟雾后，雄性小鼠和切除卵巢的雌性小鼠发展为更严重的肺气肿。在此，我们展示了雄性和雌性小鼠肺组织之间不同的批量及单细胞转录组图谱。对批量肺RNA测序数据进行加权基因共表达网络分析，识别出一个与雄性性别和卵巢切除相关的绿色基因模块。该绿色基因模块在暴露于空气或香烟烟雾五个月的83，698个小鼠细胞中富集的常见单核细胞祖细胞、经典单核细胞、1型树突状细胞和巨噬细胞中富集。性别二态性改变了富集绿色基因模块的细胞簇的组成和转录组。这项全面的转录组分析增进了我们对肺气肿性肺组织重塑发展过程中由性别二态性控制的动态细胞反应的理解，并揭示了未来机制研究的潜在靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。