COPD中Siglec-1−/FSClow肺泡巨噬细胞促炎表型数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE199345

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者的肺泡巨噬细胞（AMs）协调气道中的持续性炎症，然而，主要参与慢性炎症的肺泡巨噬细胞亚群特征尚不明确。我们最近报道了Siglec-1参与识别和吞噬不可分型流感嗜血杆菌，并且COPD肺组织中AMs上Siglec-1的表达降低。在此，基于Siglec-1的表达和流式细胞术检测的前向散射光（FSC）强度，我们鉴定出肺泡巨噬细胞中存在的三个亚群：Siglec-1+/FSChi、Siglec-1−/FSChi、Siglec-1−/FSClow亚群。Siglec-1−/FSClow亚群在COPD受试者肺内数量增加。RNA测序显示，与其他两个亚群相比，Siglec-1−/FSClow亚群表现出促炎和产蛋白酶表型。在临床上，COPD受试者诱导痰巨噬细胞中Siglec-1表达强度的降低与前瞻性四年内的急性加重率相关。

总体而言，Siglec-1− AMs表现出促炎特性，其在COPD气道中的出现是急性加重的危险因素。Siglec-1−/FSClow亚群可能作为“致病性巨噬细胞”，导致COPD患者临床结局不良。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。