机械通气心源性休克患者支气管肺泡灌洗液microRNA表达数据集
该数据集来自NCBI GEO（GSE197752），收录机械通气心源性休克患者支气管肺泡灌洗液中的microRNA表达谱，采用高通量测序进行非编码RNA分析，包含1个series matrix文件
基本信息
资源简介
机械通气心源性休克患者支气管肺泡灌洗液microRNA表达数据集
GSE197752 数据集来自 NCBI GEO，主题为机械通气心源性休克患者支气管肺泡灌洗液中的 microRNA 表达谱。该数据集采用高通量测序开展非编码 RNA 分析，属于呼吸系统疾病 / 其他分类，共包含 1 个文件，样例文件为 GSE197752_series_matrix.txt.gz。数据集由 Guillermo M. Albaiceta 提交，发布时间为 Mar 02 202，主题标签涉及 Non-coding RNA profiling by high throughput sequencing、GPL18573 和 9606。整体而言，该数据集面向机械通气相关肺损伤的生物标志物探索，提供支气管肺泡灌洗液中 microRNA 表达的高通量测序数据，可供非编码 RNA 表达谱分析与呼吸系统疾病研究参考。
【数据集背景】
机械通气是重症患者的重要支持手段，但肺实质的过度牵张可能导致组织损伤。源站描述指出，目前尚缺乏针对肺牵张的特异性生物标志物。该数据集正是在这一背景下，聚焦机械通气心源性休克患者的支气管肺泡灌洗液，分析其中的 microRNA 表达情况，以非编码 RNA 为切入点，为探索肺牵张相关损伤的分子标志物提供数据基础。
【数据内容】
该数据集收录机械通气心源性休克患者支气管肺泡灌洗液中的 microRNA 表达谱，采用高通量测序进行非编码 RNA 分析。数据集文件数量为 1，文件样例为 GSE197752_series_matrix.txt.gz，属于 series matrix 格式的数据文件。主题标签包括 Non-coding RNA profiling by high throughput sequencing、GPL18573 和 9606，分别对应非编码 RNA 高通量测序分析、平台编号与人类物种编号。数据内容围绕 microRNA 表达展开，适合用于非编码 RNA 层面的表达谱比较与候选分子筛选。
【采集与来源】
数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI GEO 数据库收录的数据集，编号为 GSE197752。源站标题为 microRNA expression in bronchoalveolar lavage fluid from mechanically ventilated patients with cardiogenic shock。作者为 Guillermo M. Albaiceta，发布时间为 Mar 02 202。样本类型为机械通气心源性休克患者的支气管肺泡灌洗液，检测对象为 microRNA。关于样本量、纳入排除标准、测序平台的具体型号与测序策略等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病相关研究，尤其是机械通气条件下肺损伤生物标志物的探索。研究者可基于支气管肺泡灌洗液中的 microRNA 表达谱，开展非编码 RNA 表达分析、候选 microRNA 筛选以及与其他公共数据集的比较分析。主题标签中的高通量测序与非编码 RNA 分析提示其可用于转录组层面的非编码 RNA 研究。由于数据集聚焦心源性休克并接受机械通气的患者，也可作为重症呼吸支持相关分子机制研究的参考数据。具体临床分组与统计比较设计，源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时，可先下载数据文件 GSE197752_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，读取前需按 GZIP 格式解压或直接以相应方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于文件为 series matrix 格式，通常包含样本信息与表达矩阵，具体字段含义需结合文件实际内容核对。分析时可围绕 microRNA 表达值开展预处理、归一化与差异分析等常规步骤。关于平台注释文件与原始测序数据的获取方式，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集文件数量为 1，仅提供 series matrix 文件样例，未提供原始测序数据或其他辅助文件的说明。样本量、测序深度、数据质控指标等信息源站未提供，因此难以在未核对文件内容的情况下评估数据质量。数据集聚焦机械通气心源性休克患者，样本类型为支气管肺泡灌洗液，研究结论的外推需谨慎。发布时间为 Mar 02 202，具体年份信息不完整。关于伦理审批、知情同意及数据使用限制，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Guillermo M. Albaiceta，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集编号为 GSE197752。使用时应引用该数据集及其来源页面。关于具体的引用格式、许可条款与数据使用政策，源站未提供，建议在使用前查阅 NCBI GEO 页面上的相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE197752
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
理由：肺实质的过度牵张可能导致组织损伤，尤其是在机械通气期间。目前尚无肺牵张的特异性生物标志物。目的：识别与肺牵张特异性相关的微小RNA和基因的转录组特征，并在临床前模型中对其进行验证。方法：系统汇总实验模型中微小RNA对牵张反应的表达数据。特征被鉴定为在牵张细胞样本中差异表达的微小RNA或基因，并使用贪心算法进行优化。转录组评分计算为上调与下调特征表达几何均数之差，并在不同牵张强度之间进行比较。这些评分的准确性在肺损伤动物模型、离体机械通气人肺以及不同通气条件下患者的支气管肺泡灌洗液（BALF）中进行了验证。测量与主要结果：在牵张细胞培养物中（n=24），有八个微小RNA存在差异表达。
在这些微小RNA调控的基因中，于离体模型（n=106）中鉴定出一个180基因特征，并利用动物模型数据（n=143）进行优化，最终获得一个4基因特征。在接受牵张或损伤性机械通气的样本中，相应评分显著更高。这些微小RNA特征在人体组织和支气管肺泡灌洗液中得到验证，用于识别肺过度膨胀的ROC曲线下面积分别为0.89至1。结论：肺细胞牵张可诱导特定微小RNA和基因的表达。这些特征可用于获取可在床旁测量的肺过度牵张指数。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
