SARS-CoV-2感染小鼠肺多组学评估揭示宿主反应动态

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE196488

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

从对SARS-CoV-2感染敏感的小鼠模型中，不同时间点连续采集肺组织，用于转录组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组的评估。我们展示了肺部在病毒感染过程中多种宿主反应的起伏变化。感染不同阶段，调控网络的信号通路和激酶发生交替变化。我们的研究不仅揭示了SARS-CoV-2感染期间肺部病理生理学的动态变化及其潜在分子机制，还突出了一些可能指导未来COVID-19治疗研究的分子和信号通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。