小鼠原发冲击波肺损伤相关circRNA-miRNA-mRNA网络数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE195726

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景。原发性冲击波肺损伤（PBLI）是冲击伤患者的主要死因，然而临床实践中对PBLI尚无诊断方法和有效治疗手段。环状RNA（circRNA）正成为多种疾病的新型调控因子，而circRNA在PBLI中的作用在很大程度上仍不清楚。本研究旨在探究PBLI相关的circRNA，为PBLI的诊断和治疗提供新思路。方法。通过转录组高通量测序筛选差异表达（DE）的circRNA和mRNA谱。对差异表达的circRNA线性转录本和mRNA进行GO和KEGG通路富集分析，以探究其潜在功能。基于DE circRNA-miRNA配对和PBLI相关mRNA-miRNA配对构建circRNA-miRNA-mRNA网络。结果。PBLI中共有117个circRNA和681个mRNA异常表达，其中64个circRNA上调、53个circRNA下调，315个mRNA上调、366个mRNA下调。GO和KEGG分析显示，上调的circRNA可能参与MAPK信号通路，下调的circRNA可能参与TGF-β信号通路。

差异表达的mRNA可能涉及TNF信号通路和范可尼贫血通路。共预测了89个PBLI相关circRNA和156个circRNA-miRNA-mRNA相互作用，这些circRNA可能参与PBLI中的炎症、氧化应激或DNA损伤修复。结论。本研究基于PBLI中circRNA和mRNA的表达改变，揭示了circRNA-miRNA-mRNA网络。我们的结果可能为PBLI的发生提供信息，并为PBLI的诊断和治疗提供新思路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。