GSE194313:肺微出血驱动α-1抗胰蛋白酶缺乏症中巨噬细胞活化与氧化/炎症损伤

该数据集来自NCBI GEO,包含GSE194313系列矩阵文件,聚焦α-1抗胰蛋白酶缺乏症(AATD)中肺微出血与巨噬细胞活化的关系

geo
浏览 12
医学影像分类GPL216979606
GSE194313: Lung microhemorrhage drives macrophage activation and oxidative/inflammatory damage in α-1 antitrypsin deficiency

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

GSE194313:肺微出血驱动α-1抗胰蛋白酶缺乏症中巨噬细胞活化与氧化/炎症损伤

Lung microhemorrhage drives macrophage activation and oxidative/inflammatory damage in α-1 antitrypsin deficiency

该数据集来自NCBI GEO,包含GSE194313系列矩阵文件,聚焦α-1抗胰蛋白酶缺乏症(AATD)中肺微出血与巨噬细胞活化的关系。研究利用支气管肺泡灌洗液和肺组织外植体,检测游离血红素和铁浓度,通过RNA测序分析肺泡巨噬细胞活化模式,并在体外用血红素刺激单核细胞来源巨噬细胞验证,同时评估组织铁沉积与氧化损伤。数据可用于探索AATD肺损伤的分子标志物及巨噬细胞炎症机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 25 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景。弹性蛋白酶气管内滴注的动物模型显示,未被α-1抗胰蛋白酶(AAT)拮抗的弹性蛋白酶可诱导肺泡出血,继而引发巨噬细胞炎症和肺损伤。目的。利用α-1抗胰蛋白酶缺乏症(AATD)受试者的支气管肺泡灌洗液(BAL)样本和肺组织外植体,识别肺泡出血和损伤的标志物。方法。评估BAL样本(17例患者,15例对照)的游离血红素和铁浓度。通过RNA测序评估肺泡巨噬细胞(AlvMac)活化模式,并在体外使用血红素刺激的单核细胞来源巨噬细胞(MDM)进行验证。通过普鲁士蓝染色和铁蛋白免疫组化评估肺组织外植体(7例患者,4例对照)的铁隔离模式,并通过电子显微镜(EM)进行铁蛋白铁成像和元素分析。组织氧化损伤评估

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21697、9606。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE194313

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 25 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE194313

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景。弹性蛋白酶气管内滴注的动物模型显示,弹性蛋白酶在缺乏α-1抗胰蛋白酶(AAT)拮抗的情况下,可诱导肺泡出血,继而引发巨噬细胞炎症和肺损伤。目的。利用AAT缺陷(AATD)受试者的支气管肺泡灌洗液(BAL)样本和肺组织外植体,识别肺泡出血和损伤的标志物。方法。评估BAL样本(17例患者,15例对照)中游离血红素和铁浓度。通过RNA测序评估肺泡巨噬细胞(AlvMac)活化模式,并利用血红素刺激的单核细胞衍生巨噬细胞(MDM)进行体外验证。通过普鲁士蓝染色和铁蛋白免疫组化评估肺外植体(7例患者,4例对照)的铁隔离模式,并通过电子显微镜(EM)进行铁蛋白铁成像和元素分析。通过8-OHdG免疫组化评估组织氧化损伤。结果。BAL显示肺叶水平游离血红素和铁浓度显著升高。BAL巨噬细胞RNA测序显示固有促炎活化,与游离血红素活化一致。

AATD组织的肺泡和间质巨噬细胞显示铁和铁蛋白积累升高,大量溶酶体中充满带有氧化铁核心和降解铁蛋白笼的沉积物。AATD外植体显示肺上皮细胞和巨噬细胞中存在大量氧化性DNA损伤。结论。鉴定BAL和组织中肺泡出血的标志物,结合巨噬细胞先天促炎激活和氧化损伤的分子和细胞证据,与游离血红素刺激一致,为弹性蛋白酶诱导的肺泡出血AATD肺气肿的致病作用提供了离体证据,正如动物研究所显示的那样。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案