儿童呼吸系统过敏中独特的上皮基因表达表型

该数据集来自 NCBI GEO,标题为儿童呼吸系统过敏中独特的上皮基因表达表型,属于呼吸系统疾病分类下的表达谱芯片数据。该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,可用于研究儿童呼吸系统过敏相关上皮基因表达表型,并支持基于表达谱的样本分类分析(来源 NCBI)

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL62449606
GSE19190: Distinct epithelial gene expression phenotypes in childhood respiratory allergy

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

儿童呼吸系统过敏中独特的上皮基因表达表型

GSE19190 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达谱数据集,英文全称为 “GSE19190: Distinct epithelial gene expression phenotypes in childhood respiratory allergy”,中文可译为“儿童呼吸系统过敏中独特的上皮基因表达表型”。该数据集归属于呼吸系统疾病分类下的“其他”类别,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,由作者 Kevin、Lebrigand 提交,发布时间为 Nov 25 200。数据集以 SuperSeries 形式组织,源站说明其由下方列出的若干 SubSeries 组成。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE19190_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及 Expression profiling by array、GPL6244 与 9606,整体围绕儿童呼吸系统过敏相关上皮基因表达表型展开,可用于基于表达谱的样本分类分析。

【数据集背景】

该数据集聚焦儿童呼吸系统过敏这一主题,标题明确指出其研究对象是儿童呼吸系统过敏中“独特的上皮基因表达表型”。从分类上看,它被归入呼吸系统疾病类别,说明其应用背景与呼吸系统疾病的机制研究相关。数据集以 SuperSeries 的形式发布,源站描述说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,这一组织方式表明数据集在结构上是对若干子系列的综合汇总。作者信息记录为 Kevin、Lebrigand,发布时间为 Nov 25 200。关于该数据集更具体的立项背景、研究动机与实验设计目标,源站未提供。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE19190_series_matrix.txt.gz,从文件名可以看出其为系列矩阵文件,并以 GZIP 压缩格式存放。主题标签中包含 Expression profiling by array,表明数据属于芯片表达谱类型;GPL6244 为平台标识,9606 为物种标识。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未进一步展开各子系列的具体内容。关于样本数量、分组构成、检测基因数量、表达值范围等具体数据规模信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库,属于公共基因表达数据资源。数据由作者 Kevin、Lebrigand 提交,发布时间记录为 Nov 25 200。数据集以 SuperSeries 形式组织,其下包含若干 SubSeries,具体子系列的数量与名称源站未提供。关于样本采集方式、实验平台细节、数据处理流程等采集层面的信息,源站未提供。

【适用场景】

根据数据集主题与类型,该数据可用于研究儿童呼吸系统过敏相关的上皮基因表达表型,并支持基于表达谱的样本分类分析。其芯片表达谱属性使其适合用于比较不同样本之间在上皮基因表达层面的差异,进而探索与儿童呼吸系统过敏相关的表达模式。由于数据集以 SuperSeries 形式组织并包含 SubSeries,使用时可结合子系列结构开展分层分析。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可下载数据文件 GSE19190_series_matrix.txt.gz,并按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段解析或编码不一致导致的分析偏差。由于数据集为 SuperSeries,使用中应注意其由 SubSeries 组成这一结构特点,结合具体分析目的选择相应数据内容。关于读取工具、预处理步骤与标准化方法等更详细的使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

数据集来自 NCBI GEO 公共数据库,具备明确的来源站、作者与发布时间记录,并以系列矩阵文件形式提供数据。其 SuperSeries 结构意味着数据集是对子系列的汇总,使用时需留意子系列之间的组织关系。数据集仅包含 1 个文件,文件样例为 GSE19190_series_matrix.txt.gz。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应以及样本量是否充分等具体质量信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者记录为 Kevin、Lebrigand,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 Nov 25 200。使用时应遵循 NCBI GEO 的相关使用要求并引用该数据集。关于具体的许可条款、使用限制与推荐引用格式,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE19190

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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