雪貂SARS-CoV-2感染的年龄依赖性致病特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE189619

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管健康人群中SARS-CoV-2的血清阳性率在各年龄组间无显著差异，但65岁及以上人群的COVID-19死亡率较年轻个体显著升高。为进一步了解不同年龄患者COVID-19表现的差异，研究将三个年龄组的雪貂感染SARS-CoV-2。虽然无论年龄大小，所有雪貂均可分离出SARS-CoV-2，但与幼年（≤6个月）和年轻成年（1-2年）组相比，老年雪貂（≥3岁）表现出更高的病毒载量、更长的鼻腔排毒时间，以及更严重的肺部炎症细胞浸润和临床症状。此外，与感染病毒的老年组同笼饲养的直接接触雪貂比与感染病毒的幼年或年轻成年雪貂同笼饲养的直接接触雪貂排出更多病毒。对老年雪貂肺部的转录组分析显示，与I型干扰素、活化T细胞和M1巨噬细胞反应相关的基因集高度富集，模拟了重症COVID-19患者的基因表达谱。

因此，感染SARS-CoV-2的老年雪貂高度重现了具有严重症状的COVID-19患者情况，对于理解SARS-CoV-2与年龄相关的感染、传播及发病机制颇为有用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。