SARS-CoV-2感染肺上皮细胞中组蛋白H4升高并与COVID-19严重程度相关
该数据集来自NCBI GEO,包含SARS-CoV-2感染肺上皮细胞中组蛋白H4升高并与COVID-19严重程度相关的研究数据

基本信息
资源简介
SARS-CoV-2感染肺上皮细胞中组蛋白H4升高并与COVID-19严重程度相关
Histone H4 is increased in SARS-CoV-2-infected lung epithelial cells and linked to COVID-19 severity
该数据集来自NCBI GEO,包含SARS-CoV-2感染肺上皮细胞中组蛋白H4升高并与COVID-19严重程度相关的研究数据。数据整合了特发性肺纤维化(IPF)和慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者及对照的内皮细胞样本的bulk RNA测序,以及已发表的COVID-19和IPF患者及对照的外周血单核细胞或支气管肺泡灌洗液细胞的测序数据。数据集含1个文件,可用于探索组蛋白H4作为COVID-19发病机制潜在生物标志物的表达特征及预测价值(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 24 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们发现组蛋白H4是COVID-19发病机制的潜在生物标志物。除了已发表的来自COVID-19和IPF患者及对照的外周血单核细胞或支气管肺泡灌洗液细胞的测序数据外,还使用了来自特发性肺纤维化(IPF)和慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者及对照的内皮细胞样本的bulk RNA测序。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL20301、9606。本站分类:呼吸系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167410
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167410
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们发现组蛋白H4是COVID-19发病机制的潜在生物标志物。除了已发表的来自COVID-19和IPF患者及对照组的外周血单核细胞或支气管肺泡灌洗液细胞的测序数据外,我们还使用了来自特发性肺纤维化(IPF)和慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者及对照组的内皮细胞样本的批量RNA测序。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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