重症COVID-19患者肺中表达GM-CSF的组织驻留记忆样Th17细胞的克隆扩增与活化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167118

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

过度炎症反应可导致肺损伤并继发急性呼吸窘迫综合征（ARDS），在重症COVID-19中具有高死亡率。为探究其潜在机制，我们研究了肺部特异性免疫反应的作用。本研究对COVID-19患者支气管肺泡灌洗液（BAL）和血液中的淋巴细胞及髓系细胞进行了分析。通过跨组织追踪T细胞克隆，我们在病毒清除后的肺部中鉴定出克隆扩增的组织驻留记忆样Th17细胞（Trm17细胞）。这些Trm17细胞的特征在于具有潜在致病性的细胞因子谱，表达IL17A和CSF2（GM-CSF）。相互作用组分析揭示，Trm17细胞与巨噬细胞及细胞毒性CD8+ T细胞存在相互作用，后者与疾病严重程度和肺损伤相关。COVID-19患者血清中高水平的IL-17A和GM-CSF蛋白与重症临床病程相关。本研究提示，肺部Trm17细胞是重症COVID-19过度炎症反应的 orchestrator 之一，且这些细胞及其细胞因子（如GM-CSF）是有前景的生物标志物和COVID-19治疗的潜在靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。