GSE166852:TLR5激动剂在指导先天宿主防御基因集中的作用
研究关注 TLR5 激动剂在指导先天宿主防御基因集中的作用,源站描述指出 TLR5 激动剂预处理可保护小鼠免受博来霉素诱导的肺纤维化,并在分选的 2 型肺泡上皮细胞和支气管上皮细胞中发现先天宿主防御基因集选择性升高

基本信息
资源简介
GSE166852:TLR5激动剂在指导先天宿主防御基因集中的作用
The roles of TLR5-agaonist in directing innate, host defense gene sets
该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件(GSE166852_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为 GPL24247。研究关注 TLR5 激动剂在指导先天宿主防御基因集中的作用,源站描述指出 TLR5 激动剂预处理可保护小鼠免受博来霉素诱导的肺纤维化,并在分选的 2 型肺泡上皮细胞和支气管上皮细胞中发现先天宿主防御基因集选择性升高。数据可用于呼吸系统疾病及肺纤维化相关基因表达研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 16 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):TLR5 是一种针对鞭毛蛋白的病原体识别受体,表达于多种上皮细胞和免疫细胞。用 TLR5 激动剂预处理的小鼠可免受博来霉素诱导的肺纤维化。然而,TLR5 激动作用保护免受肺纤维化的机制仍有待确定。在此,我们发现先天宿主防御基因集在经 TLR5 激动剂处理的动物的分选(1)2 型肺泡上皮细胞和(2)支气管上皮细胞中选择性升高。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE166852
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 13 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
TLR5是一种针对鞭毛蛋白的病原体识别受体,表达于多种上皮细胞和免疫细胞中。预先接受TLR5激动剂处理的小鼠对博来霉素诱导的肺纤维化具有保护作用。然而,TLR5激动作用保护免受肺纤维化的机制仍有待确定。在此,我们发现,在接受TLR5激动剂处理的动物中,分选的(1)2型肺泡上皮细胞和(2)支气管上皮细胞中先天宿主防御基因集选择性升高。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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