健康外周中性粒细胞总RNA-Seq：血清淀粉样P成分是抗烟曲霉感染的关键要素

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE163533

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数据说明

血清淀粉样P成分（SAP；APCS基因，又称五聚素2，PTX2）是固有免疫体液臂的组成部分，参与抵抗细菌感染和组织重塑的调节。本研究旨在探究SAP/PTX2在抗真菌抵抗中的作用。SAP缺陷的Apcs-/-小鼠对烟曲霉感染的易感性显著增加。通过体外调理烟曲霉分生孢子以及体内给予鼠源SAP，挽救了基因靶向小鼠缺陷的抗真菌抵抗能力。小鼠和人SAP结合分生孢子，激活补体级联反应，并增强小鼠和人中性粒细胞的吞噬作用。Apcs-/- SAP缺陷小鼠的抵抗缺陷与肺内中性粒细胞募集和吞噬作用的体内缺陷相关。SAP的调理活性依赖于补体激活的经典途径。在免疫抑制小鼠中，给予SAP可保护宿主免受烟曲霉感染和死亡。

在一项造血干细胞移植研究中，人类APCS基因的遗传变异与侵袭性肺曲霉病的易感性相关。因此，SAP是一种液相模式识别分子，对于抵抗烟曲霉至关重要。此处报告的结果还表明，SAP对一种代表严峻临床挑战的感染因子具有治疗潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。