Burkholderia multivorans中组蛋白样类核结构蛋白过表达影响细胞包膜依赖性性状

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE162693

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数据说明

洋葱伯克霍尔德菌复合群细菌包括机会性病原体，可在囊性纤维化（CF）患者中引起慢性呼吸道感染。这些微生物产生胞外多糖，被认为是毒力决定因素。在此，我们报道了在祖先菌株多噬伯克霍尔德菌ATCC 17616经历长期稳定期后，分离到一种进化的非黏液型变异株（17616nmv）。该变异株缺乏胞外多糖cepacian生物合成与bce基因表达下调相关。此外，该变异株的基因组序列鉴定出IS406家族的一个可移动元件转座至一个hns样基因（Bmul_0158）的启动子区域，该基因编码一种组蛋白样核仁结构蛋白，是一种已知的全局转录抑制因子。该IS元件上调了Bmul_0158基因的表达。转录组分析确定了该突变对基因表达的全局影响，主要在运动性、菌毛合成、VI型分泌和染色体相关功能方面发生重大变化。

与这些差异相伴的是，非黏液型变体对CF肺支气管细胞系的黏附性降低，表面疏水性降低，形成的细胞聚集体较小，但游泳和群集运动能力增强。最后，通过生物信息学分析鉴定出多个基因组区域，这些区域可能通过水平基因转移获得，并在非黏液型变体中因hns基因表达增加而转录受到抑制。综上所述，我们的结果揭示了该H-NS蛋白在调控B. multivorans持久性和毒力相关基因中的重要作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。