GSE162635：表达谱提示表面完整性丧失与再生修复失败是COPD进展的主要驱动力

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE162635

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性阻塞性肺疾病对公共卫生构成重大风险，然而对其详细的病理生理学知之甚少。将COPD定义为不可逆的肺阻塞，可能更多地揭示了该疾病的空间定位，而非其机制。我们进行了一项对照观察性研究，允许同时评估COPD的临床和生物学发展。16名健康对照者和104名患有慢性支气管炎的受试者（基线时伴有或不伴有肺阻塞）被纳入研究，使用支气管阻塞的程度和变化作为分析肺组织基因表达的主要评分标准。我们识别出410个与COPD进展显著相关的基因。其中110个基因表现出独特的表达模式，其功能注释表明它们参与细胞连贯性、膜完整性、生长与分化以及炎症和纤维增殖性修复的调节。

该调控模式提示一种序贯展开的病理过程，其核心是表面完整性的两步式失效：最早在慢性支气管炎阶段即以上皮黏附性的丧失为起点。自GOLD I期开始，再生修复能力下降，继而激活ECM透明质酸的降解，导致支气管壁的结构性失效，最终只能通过瘢痕形成得以解决。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。