健康与CF供者体外支气管、鼻腔及息肉细胞的miRNA库

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159708

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

囊性纤维化（CF）是一种遗传性疾病，以慢性肺病为特征。小非编码RNA是基因表达的关键调控因子，参与多种过程，而这些过程在CF中存在失调；然而，它们的研究仍不充分。在此，我们在三种CF离体模型中确定了完整的微小RNA（miRNA）表达模式。通过深度测序，获得了来自CF患者和非CF对照者的气道上皮（支气管、鼻细胞和鼻息肉）样本的气液界面培养物的miRNA谱。与非CF对照相比，CF样本中有几种miRNA失调，例如miR-181a-5p和miR-449家族上调。此外，成熟miRNA相对于其参考序列常表现出变异（即isomiR），如miR-101，表明miRNA由多种异构体组成的异质性库构成，对基因表达具有不同影响。对miR-181a-5p和miR-101-3p作用分析表明，它们调控WISP1的表达，而WISP1是细胞增殖/迁移程序的关键组分。

我们研究表明，miR-101和miR-181a-5p通过调控WISP1 mRNA及蛋白水平，参与了伤口愈合程序的异常重演。我们的miRNA表达数据为CF病理生理学提供了新见解，并为CF定义了新的潜在治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。