呼吸道病毒感染患者与健康对照血液RNAseq分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE157240

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究的目的是了解宿主对不同病毒病原体转录反应的共有和独特要素。我们在美国和斯里兰卡确定了162名受试者，他们分别感染了流感、肠道病毒/鼻病毒、人类偏肺病毒、登革病毒、巨细胞病毒、EB病毒或腺病毒。我们的数据集使我们能够在分子水平上识别常见通路以及宿主免疫反应中病毒特异性的差异。宿主对这些病毒感染反应的保守要素突显了干扰素通路激活的重要性。然而，不同病原体之间的反应强度有所差异。我们还识别了针对流感、肠道病毒/鼻病毒和登革病毒感染的病毒特异性反应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。