全血转录组分析揭示SARS-CoV-2 ORF8为潜在治疗与疫苗靶点

研究比较了感染突变型SARS-CoV-2(Δ382,ORF8中382个核苷酸缺失)的患者与野生型SARS-CoV-2感染者的全血转录组谱,发现两者存在差异

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基因组分类GPL203019606疫苗编码
GSE155454: Whole blood transcriptome analysis reveals SARS-CoV-2 ORF8 as a potential therapeutic and vaccine target

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-30

资源简介

全血转录组分析揭示SARS-CoV-2 ORF8为潜在治疗与疫苗靶点

Whole blood transcriptome analysis reveals SARS-CoV-2 ORF8 as a potential therapeutic and vaccine target

该数据集为GSE155454,来源于NCBI,包含1个文件(GSE155454_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序平台GPL20301对9606(人类)全血样本进行转录组分析。研究比较了感染突变型SARS-CoV-2(Δ382,ORF8中382个核苷酸缺失)的患者与野生型SARS-CoV-2感染者的全血转录组谱,发现两者存在差异。数据可用于探索Δ382突变对宿主免疫反应的影响机制,并为疫苗和抗病毒药物研发提供潜在靶点信息(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 30 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)中的开放阅读框(ORF)8与宿主适应和病毒复制相关,是突变热点。然而,突变对宿主免疫反应的影响尚不清楚。在此,对感染突变型SARS-CoV-2(Δ382;ORF8中382个核苷酸缺失)的患者进行的全血转录组分析显示,其表达谱与野生型SARS-CoV-2不同。了解Δ382的机制和效应将有助于集中开展疫苗和抗病毒药物的研发。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL20301、9606。本站分类:呼吸系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE155454

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 24 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoVs)中的开放阅读框8(ORF8)与宿主适应和病毒复制相关,是突变热点。然而,突变对宿主免疫反应的影响尚不清楚。本研究对感染突变型SARS-CoV-2(Δ382;ORF8中382个核苷酸缺失)的患者进行全血转录组学分析,结果显示其转录谱与野生型SARS-CoV-2不同。了解Δ382的机制和效应将有助于在疫苗和抗病毒药物研发中采取更有针对性的方法。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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