气道巨噬细胞表观遗传重编程驱动极化与炎症（WGBS_BL）
该数据集来自 NCBI GEO（GSE154803），聚焦粘液阻塞性肺病中气道巨噬细胞的表观遗传重编程。可用于分析粘液微环境相关的 DNA 甲基化差异、表观遗传调控通路及巨噬细胞极化与炎症反应机制（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
气道巨噬细胞表观遗传重编程驱动极化与炎症（WGBS_BL）
Epigenetic reprogramming of airway macrophages drives polarization and inflammation in muco-obstructive lung disease (WGBS_BL)
该数据集来自 NCBI GEO（GSE154803），聚焦粘液阻塞性肺病中气道巨噬细胞的表观遗传重编程。数据为全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS_BL）的甲基化谱，包含 1 个文件（GSE154803_series_matrix.txt.gz），物种为小鼠（10090），平台为 GPL13112。可用于分析粘液微环境相关的 DNA 甲基化差异、表观遗传调控通路及巨噬细胞极化与炎症反应机制（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jul 21 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：囊性纤维化和 COPD 等肺部疾病以粘液阻塞和慢性气道炎症为特征，但其机制联系仍知之甚少。在此，我们聚焦于粘液滞留的气道微环境对气道巨噬细胞（AM）表观遗传重编程的作用及其导致的转录组和表型变化。使用粘液阻塞性小鼠模型（Scnn1b 转基因），我们鉴定了参与炎症反应和巨噬细胞极化的、受表观遗传调控的差异调节通路和转录因子。用粘液对野生型 AM 进行离体刺激诱导了基因表达变化，与 Scnn1b 转基因小鼠 AM 中观察到的变化相当。在功能上，Scnn1b 转基因小鼠的 AM 在脂多糖攻击后表现出胞葬作用、吞噬作用受损和过度炎症反应，介导
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL13112、10090。本站分类：呼吸系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE154803
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 30 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
肺疾病，如囊性纤维化和COPD，以黏液阻塞和慢性气道炎症为特征，但其机制联系仍知之甚少。在此，我们聚焦于黏液淤滞性气道微环境对气道巨噬细胞（AM）表观遗传重编程的作用及其导致的转录组和表型变化。利用黏液阻塞性小鼠模型（Scnn1b转基因），我们鉴定了参与炎症反应和巨噬细胞极化的表观遗传调控的差异调节通路和转录因子。用黏液离体刺激野生型AMs可诱导基因表达变化，与Scnn1b转基因小鼠AMs中观察到的变化相当。在功能上，Scnn1b转基因小鼠的AMs在脂多糖刺激下表现出胞葬作用、吞噬作用受损以及过度的炎症反应，这是通过增强的Irf1活性和表达介导的。我们的数据表明，黏液淤滞诱导AMs的表观遗传重编程，导致有利于组织损伤和疾病进展的变化。靶向这些改变的AMs可能为黏液阻塞性肺疾病患者的治疗提供支持。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
