囊性纤维化气道上皮细胞气液界面培养异常炎症与脂质代谢RNA表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE154802

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

囊性纤维化（CF）中囊性纤维化跨膜传导调节因子（CFTR）功能缺陷导致慢性肺病。然而，其分子机制尚未被充分理解，能够帮助所有患者的疗法仍然难以实现。CF与脂肪酸、神经酰胺和胆固醇的异常相关，因此我们采用质谱、蛋白质芯片和RNAseq分析，研究了CFTR缺陷对气道上皮脂质代谢和促炎信号传导的影响。我们在CF小鼠肺以及CFTR敲除猪和CF患者良好分化的支气管上皮细胞培养物中，观察到基础状态下脂肪酸和神经酰胺代谢的显著失衡，并伴有慢性氧化应激。三种CF模型的细胞自主特征均包括ω-6与ω-3多不饱和脂肪酸比值升高，以及长链与超长链神经酰胺种类（LCC/VLCC）比值升高。抗氧化剂谷胱甘肽（GSH）和去铁胺部分纠正了脂质谱，表明氧化应激可能促进脂质异常。

靶向CFTR的调节剂减少了脂质失衡和明显的氧化应激，证实了脂质比例对CFTR的依赖性。RNA测序和蛋白质阵列分析显示，与非CF细胞相比，CF上皮细胞中细胞因子和生长因子的表达及脱落更高，这与基础条件下的无菌性炎症和组织重塑相一致。使用抗氧化剂或模拟已批准联合疗法Orkambi和Trikafta的CFTR调节剂治疗并未抑制炎症表型。这些结果表明，抗炎疗法可能为服用CFTR调节剂药物的CF患者提供额外益处。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。