野生型与Nlrx1缺陷骨髓来源单核样树突状细胞应对烟曲霉活分生孢子的时间进程RNA-Seq分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE143964

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

烟曲霉是一种呼吸道机会性真菌病原体，可引起侵袭性感染或过敏反应。单核细胞样树突状细胞（moDCs）是真菌定植过程中已知被招募的细胞群体，被认为在平衡固有免疫与适应性免疫应答中发挥关键作用。我们对受到烟曲霉攻击的moDCs进行了RNA-Seq时间进程分析，以了解基因表达变化。我们同时使用了Nlrx1缺陷型moDCs，因为我们近期已证明Nlrx1在侵袭性肺曲霉病中的重要性，并表明Nlrx1的缺失会导致向有害Th2应答的显著偏移。我们的研究结果表明，moDCs对烟曲霉存活分生孢子作出应答时存在一种决策树机制，而该机制在Nlrx1-/- moDCs中缺失。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。