原代人肺成纤维细胞转录组图谱(囊性纤维化 vs 非囊性纤维化)

该数据集为GSE141537,提供原代人肺成纤维细胞(囊性纤维化 vs 非囊性纤维化)的转录组表达谱,基于高通量测序平台GPL24676(人,9606)产生

geo
浏览 8
基因组分类GPL246769606
GSE141537: Transcriptome profile of Primary Human Lung Fibroblasts (Cystic Fibrosis vs. Non-Cystic Fibrosis)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

原代人肺成纤维细胞转录组图谱(囊性纤维化 vs 非囊性纤维化)

GSE141537 是一个聚焦呼吸系统疾病的转录组表达谱数据集,全称为 Transcriptome profile of Primary Human Lung Fibroblasts (Cystic Fibrosis vs. Non-Cystic Fibrosis),即原代人肺成纤维细胞在囊性纤维化与非囊性纤维化状态下的转录组表达谱。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,由 Rossella、De Cegli 提交,发布时间为 2019 年 12 月 5 日。数据集基于高通量测序技术产生表达谱数据,涉及平台 GPL24676 与物种编号 9606(人),整体归类于呼吸系统疾病 / 其他方向。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE141537_series_matrix.txt.gz,适合作为研究人肺成纤维细胞在囊性纤维化背景下转录组差异的公开数据资源。

【数据集背景】

囊性纤维化是一种累及多系统的遗传性疾病,呼吸系统受累是其核心临床表现之一。肺成纤维细胞作为肺组织中的重要间质细胞,参与组织结构维持与修复过程,其在疾病状态下的转录组特征具有研究价值。该数据集以原代人肺成纤维细胞为研究对象,通过对比囊性纤维化与非囊性纤维化来源细胞的转录组表达谱,为相关研究提供表达层面的数据基础。数据集标题明确指向这一对比设计,所属分类为呼吸系统疾病 / 其他。

【数据内容】

该数据集提供原代人肺成纤维细胞(囊性纤维化 vs. 非囊性纤维化)的转录组表达谱,数据类型为高通量测序产生的表达谱数据。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676 与 9606,分别对应表达谱检测方式、测序平台与人类物种。数据集文件数量为 1,文件样例为 GSE141537_series_matrix.txt.gz,即以 GZIP 压缩形式提供的系列矩阵文件。源站描述指出该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,说明其组织结构上包含子系列。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Rossella、De Cegli,发布时间为 2019 年 12 月 5 日。样本材料为原代人肺成纤维细胞,分组对比为囊性纤维化与非囊性纤维化。测序数据基于平台 GPL24676 产生,物种为人(9606)。关于样本采集地点、供体数量、培养条件与测序具体参数等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于呼吸系统疾病尤其是囊性纤维化相关的基础研究,例如比较囊性纤维化与非囊性纤维化来源人肺成纤维细胞的转录组表达差异、筛选候选差异表达基因,以及作为同类转录组研究的参考表达谱。由于数据基于高通量测序平台产生,也适合用于表达谱分析流程的验证与整合分析探索。具体研究结论需结合实验设计与后续分析确定,源站未提供针对特定应用的说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE141537_series_matrix.txt.gz,按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以保证后续分析的一致性与准确性。由于数据集为 SuperSeries 结构,实际分析时还需关注其下属 SubSeries 的组织方式;源站未提供更详细的分析流程或推荐工具。

【质量与限制】

数据集文件数量为 1,以系列矩阵形式提供,源站未提供样本量、测序深度、重复数等质控指标,也未提供数据预处理与归一化方法的说明。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未展开各子系列的具体内容。因此在使用前应自行核查数据完整性与字段含义,并结合研究目的评估其适用性。数据集发布时间为 2019 年 12 月 5 日,后续是否更新源站未提供。

【引用与许可】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Rossella、De Cegli,发布时间为 2019 年 12 月 5 日。使用时应遵循来源站的引用规范与使用条款;关于该数据集的具体许可协议、引用格式与使用限制,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE141537

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。