原代人肺成纤维细胞转录组谱(囊性纤维化 vs 非囊性纤维化)[2D]
该数据集来自 NCBI GEO,比较囊性纤维化患者与正常人原代肺成纤维细胞的转录组表达谱,采用高通量测序平台 GPL24676,物种为人类(9606)
![GSE141535: Transcriptome profile of Primary Human Lung Fibroblasts (Cystic Fibrosis vs. Non-Cystic Fibrosis) [2D]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/184365.jpg)
基本信息
资源简介
原代人肺成纤维细胞转录组谱(囊性纤维化 vs 非囊性纤维化)[2D]
GSE141535 数据集聚焦于人类原代肺成纤维细胞在囊性纤维化与非囊性纤维化状态下的转录组表达谱比较。该数据集由 NCBI GEO 收录,来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov,属于呼吸系统疾病/其他分类。其核心内容是对囊性纤维化患者来源的人肺成纤维细胞与正常人肺成纤维细胞进行转录组层面的对比分析,采用高通量测序技术获取表达谱数据,测序平台为 GPL24676,物种为人类(9606)。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE141535_series_matrix.txt.gz,作者为 R,De Cegli,发布时间为 Dec 05 201。整体而言,该数据集为研究囊性纤维化相关肺成纤维细胞的转录组差异提供了可直接获取的表达谱资源。
【数据集背景】
囊性纤维化是一种累及呼吸系统的疾病,肺成纤维细胞作为肺组织中的重要间质细胞,其转录组状态可能与该疾病的病理过程相关。该数据集旨在通过比较囊性纤维化患者与正常人原代肺成纤维细胞的转录组表达谱,刻画两者在基因表达层面的差异。源站描述明确指出,该数据集比较了囊性纤维化人肺成纤维细胞与正常人肺成纤维细胞的转录组谱。数据集标题中标注的“[2D]”提示其对应二维培养条件下的样本类型,但源站未就培养条件的具体细节提供更多说明。
【数据内容】
该数据集的内容为原代人类肺成纤维细胞的转录组表达谱,涵盖囊性纤维化组与正常对照组。数据以高通量测序方式产生,主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”,平台编号为 GPL24676,物种编号为 9606(人类)。数据集仅包含 1 个文件,样例文件名为 GSE141535_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。该文件通常以矩阵形式组织样本与表达信息,但源站未提供矩阵内具体字段、样本数量或基因数量的进一步说明。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),由作者 R,De Cegli 提交,发布时间为 Dec 05 201。数据集标题与源站标题一致,均为“Transcriptome profile of Primary Human Lung Fibroblasts (Cystic Fibrosis vs. Non-Cystic Fibrosis) [2D]”。样本涉及囊性纤维化患者与正常人来源的原代肺成纤维细胞,测序平台为 GPL24676。除上述信息外,源站未提供样本采集地点、伦理审批信息或测序试剂等更详细的采集流程说明。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病特别是囊性纤维化相关的基础研究场景,可用于比较囊性纤维化与正常肺成纤维细胞之间的转录组表达差异,辅助识别差异表达基因或表达模式。由于采用高通量测序表达谱,其数据可用于转录组层面的探索性分析,也可作为相关研究中的参考表达谱资源。适用场景应限定在源站描述所覆盖的比较分析范围内,源站未提供该数据集在其他疾病或细胞类型中的适用性说明。
【使用方法】
使用该数据集时,可下载数据文件 GSE141535_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认数据组织方式与样本标注无误后,再批量接入后续分析流程。由于源站未提供矩阵内具体字段说明,使用前应自行检查文件结构,明确样本分组与表达值编码方式。分析时应结合平台 GPL24676 与物种人类(9606)的信息进行注释匹配。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件,源站未提供样本数量、测序深度、重复设置或质控指标等信息,因此无法依据现有信息评估其数据质量与统计效力。数据集标题中的“[2D]”提示其对应二维培养条件,源站未说明是否包含其他培养条件的数据。此外,源站未提供差异分析结果、归一化方法或批次信息,使用者在开展比较分析时需自行完成相应的数据处理与质量控制。该数据集的结论应限定在源站描述所界定的囊性纤维化与正常肺成纤维细胞转录组比较范围内。
【引用与许可】
该数据集的作者为 R,De Cegli,来源站点为 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),发布时间为 Dec 05 201。源站未提供具体的引用格式、期刊论文信息或数据使用许可条款,使用者在引用或再利用该数据集前,应查阅 NCBI GEO 页面上的相关说明以确认引用要求与使用条件。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE141535
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
The transcriptomic profile of cystic fibrosis human lung fibroblasts was compared to normal human lung fibroblasts.
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




