GSE130159：EBC中的miRNA表达
研究纳入27名受试者，比较囊性纤维化患者中铜绿假单胞菌与金黄色葡萄球菌感染相关的miRNA差异表达，并利用Ingenuity Pathway Analysis预测靶mRNA及信号通路
基本信息
资源简介
GSE130159：EBC中的miRNA表达
miRNA expression in EBC
该数据集来自NCBI GEO，标题为miRNA expression in EBC，包含1个文件（GSE130159_series_matrix.txt.gz），采用RT-PCR表达谱技术检测呼出气冷凝液（EBC）中的miRNA。研究纳入27名受试者，比较囊性纤维化患者中铜绿假单胞菌与金黄色葡萄球菌感染相关的miRNA差异表达，并利用Ingenuity Pathway Analysis预测靶mRNA及信号通路。数据可用于呼吸系统疾病中感染相关表观遗传标志物的分类与机制探索（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Apr 22 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：囊性纤维化（CF）是最常见的限制生命的遗传性疾病，其特征是继发于炎症和慢性细菌性肺部感染的慢性呼吸衰竭。与金黄色葡萄球菌感染相比，铜绿假单胞菌肺部感染与更严重的肺部疾病和呼吸衰竭的快速进展相关。我们假设，靶向特定基因转录本的特定表观遗传因子特征有助于解释慢性假单胞菌感染的CF患者发病率增加。我们从27名受试者中收集了呼出气冷凝液（EBC），并使用商业PCR阵列评估了这些样本中的miRNA特征。我们使用Ingenuity Pathway Analysis鉴定了预测的mRNA靶标和相关信号通路。我们在感染铜绿假单胞菌的患者的EBC中发现了11个差异表达的miRNA
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by RT-PCR、GPL26552、9606。本站分类：呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE130159
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 22 201，引用时请注意版本时效。
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE130159
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
囊性纤维化（CF）是最常见的限制生命的遗传性疾病，其特征是继发于炎症和慢性细菌性肺部感染的慢性呼吸衰竭。与金黄色葡萄球菌感染相比，铜绿假单胞菌肺部感染与更严重的肺部疾病和呼吸衰竭的快速进展相关。我们假设，靶向特定基因转录本的特定表观遗传因子特征有助于解释慢性假单胞菌感染的CF患者发病率增加的现象。我们收集了27名受试者的呼出气冷凝液（EBC），并使用商业PCR阵列评估了这些样本中的miRNA特征。我们使用Ingenuity Pathway Analysis鉴定了预测的mRNA靶标及相关信号通路。我们发现，与未慢性感染铜绿假单胞菌的CF患者EBC相比，感染铜绿假单胞菌的患者EBC中有11个差异表达的miRNA。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
